38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4963 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  401  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  83.64 
 
 		 225 aa  314  7e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  66.36 
 
 		 224 aa  248  7e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  57.62 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  57.14 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  56.67 
 
 		 249 aa  201  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  35.21 
 
 		 250 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  39.49 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  38.54 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  39.29 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  42.77 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  38.54 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  36.99 
 
 		 658 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  40.1 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  35.55 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  35.55 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  37.97 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  36.41 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  37.21 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  39.18 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  40.7 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  38.01 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  36.93 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  32.52 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  34.72 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  31.47 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  31.47 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  32.74 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  37.31 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  37.69 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  38.07 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  33.51 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  37.87 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  26.37 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1077  hypothetical protein  38.61 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  27.08 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0780  hypothetical protein  30.43 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1457  protein of unknown function DUF1275  27.62 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>