More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4903 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  85.94 
 
 		 393 aa  670    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  86.2 
 
 		 393 aa  673    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  94.39 
 
 		 392 aa  752    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  87.6 
 
 		 393 aa  674    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4903  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 392 aa  787    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234248  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2610  aminotransferase class I and II  86.53 
 
 		 393 aa  665    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.436935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  78.5 
 
 		 395 aa  614  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2719  aminotransferase  75.52 
 
 		 392 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  55.06 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  50.27 
 
 		 392 aa  378  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2243  aminotransferase  48.27 
 
 		 399 aa  349  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  44.92 
 
 		 387 aa  345  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  40 
 
 		 398 aa  280  4e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  39.18 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_19738  predicted protein  42.41 
 
 		 387 aa  276  5e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.242691  normal  0.116612 
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  39.18 
 
 		 398 aa  275  8e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  40.73 
 
 		 398 aa  269  5e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  37.64 
 
 		 387 aa  269  7e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  38.58 
 
 		 380 aa  269  8e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  36.86 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  38.18 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  38.1 
 
 		 392 aa  266  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  38.6 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2300  aspartate aminotransferase  37.37 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10725  normal  0.390936 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  40.59 
 
 		 400 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  38.04 
 
 		 390 aa  262  8e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  40.1 
 
 		 405 aa  262  8.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1242  aspartate aminotransferase  38.36 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  37.86 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  39.24 
 
 		 397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  39.21 
 
 		 379 aa  259  7e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1768  aminotransferase class I and II  38.36 
 
 		 399 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.214142  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1696  aminotransferase, class I and II  38.22 
 
 		 397 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0798597  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3821  aminotransferase class I and II  37.82 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  38.17 
 
 		 398 aa  256  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  39.57 
 
 		 381 aa  256  5e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1319  aminotransferase  37.69 
 
 		 398 aa  255  7e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.399658  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1087  aminotransferase  36.03 
 
 		 392 aa  255  9e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0079  aminotransferase class I and II  37.06 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.940118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1755  aminotransferase, class I and II  35.16 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  35.92 
 
 		 398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0740  aminotransferase, class I and II  38.17 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  38.87 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  36.22 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1959  aminotransferase class I and II  36.87 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  39.63 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0938  aminotransferase, class I and II  38.48 
 
 		 400 aa  253  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  38.86 
 
 		 392 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1479  aspartate aminotransferase  36.22 
 
 		 400 aa  252  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0669082 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  36.34 
 
 		 392 aa  252  7e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3243  aminotransferase class I and II  36.13 
 
 		 400 aa  252  9.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.922268 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  36.59 
 
 		 388 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  34.45 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  36.78 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  35.83 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  37.5 
 
 		 380 aa  252  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24020  aspartate aminotransferase  41.04 
 
 		 414 aa  251  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.871071  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  36.07 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1248  aminotransferase  36.57 
 
 		 409 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0135  aminotransferase class I and II  37.27 
 
 		 407 aa  250  3e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.062979  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  39.85 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  36.79 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  36.68 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1665  aminotransferase, class I and II  36.73 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0122976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  39.48 
 
 		 411 aa  249  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2233  aspartate aminotransferase  36.87 
 
 		 400 aa  249  7e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  37.19 
 
 		 390 aa  249  7e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1791  aminotransferase class I and II  35.95 
 
 		 400 aa  249  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.033856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  36.29 
 
 		 390 aa  249  9e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  38.52 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  39.24 
 
 		 415 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2030  aminotransferase class I and II  35.61 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128582  normal  0.337144 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1602  aminotransferase, class I and II  36.83 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0934572  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  35.91 
 
 		 386 aa  247  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  40.44 
 
 		 387 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  37.87 
 
 		 405 aa  247  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  34.75 
 
 		 395 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  38.87 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2344  aminotransferase class I and II  35.61 
 
 		 400 aa  247  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2070  aminotransferase class I and II  35.61 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.117536 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  41.76 
 
 		 373 aa  246  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6064  aspartate aminotransferase  40.05 
 
 		 402 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2737  aminotransferase class I and II  35.79 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  38.38 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  38.21 
 
 		 379 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1232  aspartate aminotransferase A protein  40.82 
 
 		 404 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0739615 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  37.36 
 
 		 391 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  40.46 
 
 		 411 aa  244  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  41.99 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  38.83 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2997  aspartate aminotransferase  35.86 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.423377 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1182  aminotransferase class-I  37.74 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1734  aspartate aminotransferase  36.13 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3244  aspartate aminotransferase  39.29 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  40.57 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1241  aminotransferase class I and II  36.08 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  35.33 
 
 		 396 aa  243  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0412  aspartate aminotransferase  36.48 
 
 		 400 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  33.95 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>