More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4693 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4693  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
317 aa  645    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0659  UDP-glucose 4-epimerase  43.86 
 
 
306 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1895  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.15 
 
 
311 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
317 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
309 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 
309 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 
328 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
330 aa  99  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 
309 aa  95.9  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 
323 aa  93.6  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
308 aa  93.2  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 
302 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 
302 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0679369  normal  0.411076 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 
330 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.55 
 
 
336 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.55 
 
 
336 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
326 aa  89.7  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
318 aa  89.4  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445777 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 
321 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 
321 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  26.86 
 
 
302 aa  89  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 
295 aa  89  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.443287 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.670421 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0386  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.06 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.68 
 
 
322 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.87 
 
 
336 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 
312 aa  87  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 
284 aa  87  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1703  CDP-abequose synthase  21.77 
 
 
319 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000035805 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1850  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.33 
 
 
325 aa  87  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0128954  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0624  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.29 
 
 
365 aa  86.7  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0728968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
309 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
316 aa  86.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0445125  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.69 
 
 
358 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3528  CDP-abequose synthase  22.22 
 
 
319 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.05 
 
 
335 aa  86.7  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
330 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.19 
 
 
330 aa  86.3  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1185  steroid dehydrogenase  32.66 
 
 
351 aa  85.9  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.809029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 
306 aa  85.9  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 
302 aa  85.9  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179855  normal  0.339449 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3402  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  23.28 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.16 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1538  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.05 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00186226  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  26.45 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.46 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.411668  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0478  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.63 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  unclonable  0.00000000000851226  decreased coverage  0.0000000042699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3554  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.38 
 
 
355 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110317  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 
664 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3398  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  22.85 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3810  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.16 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0909  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  24.1 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1106  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.02 
 
 
337 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3072  UDP-glucose 4-epimerase  22.95 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.14 
 
 
330 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1397  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.98 
 
 
358 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.64 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.3 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.45 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2214  CDP-abequose synthase  24.9 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.242503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3030  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  24.85 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.75 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000135991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2106  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.99 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0474818  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2315  CDP-abequose synthase  24.9 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0279345 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.16 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.69 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1272  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.41 
 
 
351 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.447034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34177  normal  0.395764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3167  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.43 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1183  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.63 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.769877  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4078  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.52 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29374  normal  0.0761668 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  30.04 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2322  CDP-abequose synthase  25 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360745  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0776  UDP-glucose 4-epimerase  26.12 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10863  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.23 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3376  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  22.64 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.7 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>