More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3582 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  100 
 
 		 329 aa  665    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  63.77 
 
 		 309 aa  413  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.27 
 
 		 291 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  56.27 
 
 		 291 aa  372  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.19 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.21 
 
 		 298 aa  345  8e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  55.18 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.15 
 
 		 277 aa  330  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  54.01 
 
 		 338 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  53.25 
 
 		 331 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  52.06 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.52 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.18 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.18 
 
 		 284 aa  269  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  47 
 
 		 280 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.81 
 
 		 277 aa  265  8e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.7 
 
 		 294 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.7 
 
 		 294 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.32 
 
 		 286 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.67 
 
 		 300 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.88 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.21 
 
 		 309 aa  262  6e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.03 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.69 
 
 		 306 aa  255  8e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.6 
 
 		 278 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.57 
 
 		 290 aa  251  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.41 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.37 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.67 
 
 		 293 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.36 
 
 		 276 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.96 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  41.96 
 
 		 285 aa  243  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.41 
 
 		 281 aa  243  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.73 
 
 		 284 aa  243  5e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.43 
 
 		 281 aa  235  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.07 
 
 		 291 aa  220  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  35.53 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  34.29 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  34.29 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  34.29 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  32.86 
 
 		 323 aa  182  1e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  35.9 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.21 
 
 		 329 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  34.94 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  32.76 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  33.71 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.5 
 
 		 200 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.57 
 
 		 154 aa  144  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.9 
 
 		 203 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 153 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.34 
 
 		 203 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  54.62 
 
 		 149 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  39.9 
 
 		 203 aa  138  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  40.51 
 
 		 203 aa  137  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.42 
 
 		 203 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.1 
 
 		 142 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  52.1 
 
 		 144 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.46 
 
 		 131 aa  136  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.49 
 
 		 203 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.03 
 
 		 207 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  52.54 
 
 		 143 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  49.19 
 
 		 124 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  38.86 
 
 		 203 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.84 
 
 		 132 aa  132  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  54.92 
 
 		 128 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50 
 
 		 150 aa  132  9e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  54.03 
 
 		 182 aa  132  9e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  51.26 
 
 		 145 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  51.26 
 
 		 122 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  51.64 
 
 		 125 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  51.26 
 
 		 143 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 123 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  51.26 
 
 		 144 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.23 
 
 		 132 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1361  FeS cluster assembly scaffold IscU  57.38 
 
 		 142 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  52.94 
 
 		 129 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  54.89 
 
 		 139 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  53.17 
 
 		 132 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.41 
 
 		 138 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.85 
 
 		 127 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.42 
 
 		 139 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  56.56 
 
 		 153 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  56.15 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  52.46 
 
 		 133 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.61 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.03 
 
 		 134 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.97 
 
 		 128 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.61 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.42 
 
 		 124 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2216  scaffold protein  54.62 
 
 		 135 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3104  scaffold protein  54.62 
 
 		 135 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1707  scaffold protein  54.62 
 
 		 135 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  54.62 
 
 		 135 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2732  scaffold protein  54.62 
 
 		 135 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1488  scaffold protein  54.62 
 
 		 135 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2598  scaffold protein  54.62 
 
 		 135 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.4 
 
 		 135 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  53.79 
 
 		 135 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  54.1 
 
 		 150 aa  126  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  50.81 
 
 		 138 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>