128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0671 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  100 
 
 		 372 aa  764    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1647  hypothetical protein  30.77 
 
 		 380 aa  126  5e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  25.28 
 
 		 425 aa  109  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  25.28 
 
 		 425 aa  109  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  25.28 
 
 		 425 aa  109  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  23.7 
 
 		 434 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  25.71 
 
 		 436 aa  96.3  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  25.57 
 
 		 424 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1116  HK97 family phage portal protein  24.27 
 
 		 396 aa  93.6  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  25.36 
 
 		 431 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  25.44 
 
 		 390 aa  92  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  25.36 
 
 		 444 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  21.65 
 
 		 524 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  23.5 
 
 		 412 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  22.7 
 
 		 413 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  24.86 
 
 		 411 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  22.66 
 
 		 413 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  23.01 
 
 		 413 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136411 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  24.55 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  21.74 
 
 		 434 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  24.07 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  25.87 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000555494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  23.16 
 
 		 416 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  23.84 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  23.43 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  22.62 
 
 		 544 aa  83.6  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  23.37 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  22.78 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  23.54 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  25.64 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  23.73 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  20.88 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  26.22 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  22.63 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  23.48 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  23.84 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  23.84 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  23.32 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  23.86 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  23.53 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  22.26 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1648  hypothetical protein  24.38 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.117092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  25.7 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  25.25 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  23.81 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  25.45 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  25.45 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  24.42 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  21.8 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  21.8 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  23.53 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  23.71 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  24.21 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  23.43 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  26.91 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  22.81 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1060  HK97 family phage portal protein  23.43 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1080  HK97 family phage portal protein  23.43 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  23.8 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  24.26 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  24.45 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000016128 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  21.05 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4963  HK97 family phage portal protein  23.53 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000373526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  20.89 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  23.3 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  24.2 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  21.43 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0586  HK97 family portal protein  25.75 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0587  HK97 family phage portal protein  25.75 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  22.02 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  24.01 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1334  phage portal protein HK97 family  21.93 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00597949  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  17.75 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  21.35 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  21.5 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  25 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  19.33 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  21.78 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0919  HK97 family phage portal protein  22.26 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.38293 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  22.92 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3916  HK97 family phage portal protein  22.49 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0348958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1429  phage portal protein, HK97 family  25.09 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  normal  0.284789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  21.36 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1130  HK97 family phage portal protein  23.47 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.868122  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2177  putative phage portal protein  22.82 
 
 		 396 aa  57  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  23.11 
 
 		 859 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  23.11 
 
 		 833 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  23.11 
 
 		 833 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  22.58 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2468  putative portal protein  23.39 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3119  Phage portal protein, HK97  23.44 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  25.14 
 
 		 225 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  18.43 
 
 		 429 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  25.1 
 
 		 398 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  20.73 
 
 		 434 aa  53.9  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2959  phage portal protein, HK97 family  25.44 
 
 		 415 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  20.87 
 
 		 436 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  20.87 
 
 		 436 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  19.6 
 
 		 409 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>