44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1647 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1647  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  778    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  30.77 
 
 
372 aa  126  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1116  HK97 family phage portal protein  28.99 
 
 
396 aa  125  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  22.9 
 
 
431 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  22.35 
 
 
444 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  25.12 
 
 
421 aa  61.2  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  19.25 
 
 
445 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  19.25 
 
 
445 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  23.79 
 
 
416 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  23.24 
 
 
409 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  22.18 
 
 
413 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000275865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  23.94 
 
 
407 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  27.66 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  24.03 
 
 
401 aa  54.7  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  23.53 
 
 
415 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  18.77 
 
 
524 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  23.86 
 
 
455 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  25 
 
 
420 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  22.9 
 
 
440 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  23.21 
 
 
457 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2177  putative phage portal protein  23.51 
 
 
396 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  22.92 
 
 
455 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  25.73 
 
 
411 aa  50.4  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  24.15 
 
 
434 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  23.28 
 
 
441 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  22.37 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  23.36 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  23.77 
 
 
393 aa  47.4  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  21.74 
 
 
434 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679414 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  23.36 
 
 
414 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  23.36 
 
 
414 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  19.61 
 
 
432 aa  47  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  20.16 
 
 
434 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  21.1 
 
 
444 aa  46.6  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  21.32 
 
 
425 aa  46.2  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  21.32 
 
 
425 aa  46.2  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  21.32 
 
 
425 aa  46.2  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1632  Phage portal protein, HK97  23.99 
 
 
386 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  23.17 
 
 
417 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3916  HK97 family phage portal protein  27.71 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0348958 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  24.01 
 
 
424 aa  44.3  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  20.97 
 
 
417 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  21.75 
 
 
411 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0919  HK97 family phage portal protein  21.1 
 
 
351 aa  42.7  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.38293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>