More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0456 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 211 aa  428  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  71.09 
 
 		 211 aa  322  2e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  70.14 
 
 		 209 aa  319  1.9999999999999998e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  70.14 
 
 		 209 aa  316  2e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  71.09 
 
 		 209 aa  308  4e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  70.62 
 
 		 209 aa  308  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  71.09 
 
 		 209 aa  308  5e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  72.04 
 
 		 209 aa  306  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  71.08 
 
 		 203 aa  299  2e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  66.35 
 
 		 209 aa  297  8e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  66.35 
 
 		 209 aa  297  8e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  66.35 
 
 		 209 aa  297  8e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  66.35 
 
 		 209 aa  297  8e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  66.35 
 
 		 209 aa  297  8e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  66.35 
 
 		 209 aa  297  8e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  66.35 
 
 		 209 aa  297  8e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  66.35 
 
 		 209 aa  297  8e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  66.35 
 
 		 209 aa  297  8e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  65.88 
 
 		 209 aa  295  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  66.82 
 
 		 209 aa  293  9e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  66.82 
 
 		 209 aa  293  9e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  65.4 
 
 		 209 aa  293  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  64.45 
 
 		 209 aa  289  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  65.88 
 
 		 209 aa  288  3e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  65.88 
 
 		 209 aa  288  4e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  64.45 
 
 		 209 aa  286  1e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  61.61 
 
 		 209 aa  283  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  61.61 
 
 		 209 aa  282  3.0000000000000004e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  65.53 
 
 		 210 aa  279  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  62.09 
 
 		 226 aa  279  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  61.61 
 
 		 209 aa  274  9e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  62.14 
 
 		 213 aa  271  5.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  59.24 
 
 		 209 aa  269  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  61.17 
 
 		 209 aa  264  5.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  58.74 
 
 		 207 aa  263  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  58.1 
 
 		 370 aa  263  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  55.45 
 
 		 209 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 		 208 aa  257  7e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  58.74 
 
 		 210 aa  257  9e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  55.45 
 
 		 209 aa  257  9e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3518  uracil phosphoribosyltransferase  55.92 
 
 		 209 aa  255  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866568  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  55.45 
 
 		 209 aa  254  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  55.45 
 
 		 209 aa  254  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  56.46 
 
 		 211 aa  253  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 		 211 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  55.29 
 
 		 210 aa  251  7e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 		 216 aa  250  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  52.86 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  52.86 
 
 		 216 aa  249  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 		 220 aa  248  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  55.83 
 
 		 208 aa  248  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1963  uracil phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 		 213 aa  247  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3218  uracil phosphoribosyltransferase  53.81 
 
 		 215 aa  247  8e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.225057  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2983  uracil phosphoribosyltransferase  53.37 
 
 		 210 aa  247  9e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.19059  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2102  uracil phosphoribosyltransferase  52.61 
 
 		 209 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2073  uracil phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 		 215 aa  246  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  54.29 
 
 		 211 aa  246  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  55.61 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  54.5 
 
 		 209 aa  245  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 		 211 aa  245  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 		 220 aa  245  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  54.5 
 
 		 209 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1306  uracil phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 		 214 aa  245  4e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.12178  normal  0.272748 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2063  uracil phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 		 216 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36489  normal  0.305714 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  55.34 
 
 		 227 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0985  uracil phosphoribosyltransferase  54.85 
 
 		 216 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1681  uracil phosphoribosyltransferase  55.34 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0731793  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2331  uracil phosphoribosyltransferase  54.85 
 
 		 216 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829387  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2316  uracil phosphoribosyltransferase  54.85 
 
 		 216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.542066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0231  uracil phosphoribosyltransferase  53.08 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2209  uracil phosphoribosyltransferase  54.85 
 
 		 216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2188  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 		 216 aa  242  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0831132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5192  uracil phosphoribosyltransferase  52.61 
 
 		 209 aa  242  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420046  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2293  uracil phosphoribosyltransferase  54.85 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5281  uracil phosphoribosyltransferase  52.61 
 
 		 209 aa  242  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5620  uracil phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 		 216 aa  241  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3343  uracil phosphoribosyltransferase  54.03 
 
 		 209 aa  241  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2661  uracil phosphoribosyltransferase  51.66 
 
 		 209 aa  241  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4319  uracil phosphoribosyltransferase  53.08 
 
 		 208 aa  241  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1302  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 		 216 aa  241  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0489544  normal  0.116474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3258  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 		 216 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0567794  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5573  uracil phosphoribosyltransferase  52.13 
 
 		 209 aa  240  9e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2519  uracil phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 		 216 aa  240  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4197  uracil phosphoribosyltransferase  54.11 
 
 		 211 aa  240  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0551495  normal  0.563023 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1986  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  54.85 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2386  uracil phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  52.61 
 
 		 210 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1787  uracil phosphoribosyltransferase  54.98 
 
 		 209 aa  238  4e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.823416  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0130  uracil phosphoribosyltransferase  54.11 
 
 		 207 aa  238  4e-62  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0360  uracil phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 		 216 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00755742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4221  uracil phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 		 210 aa  238  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1883  uracil phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 		 216 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1387  uracil phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 		 216 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1242  uracil phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 		 216 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0425998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1077  uracil phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 		 216 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475788  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0790  uracil phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 		 216 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0641631  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1016  uracil phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 		 216 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4570  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 		 205 aa  238  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000263054  normal  0.0155857 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1233  uracil phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 		 216 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>