129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2402 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2777  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  420  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.958453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2402  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  420  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 		 299 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 		 303 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 		 303 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 		 303 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  37.96 
 
 		 313 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  33.33 
 
 		 314 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  33.85 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6109  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 314 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6615  Alpha/beta hydrolase  30.22 
 
 		 302 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0109  alpha/beta fold family hydrolase  35.34 
 
 		 311 aa  48.9  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000692138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  33.04 
 
 		 309 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 294 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  30.66 
 
 		 303 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  30.66 
 
 		 303 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  27.54 
 
 		 319 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 302 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  31.48 
 
 		 337 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  30.41 
 
 		 307 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 302 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 285 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 302 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 		 344 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 		 318 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 		 346 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 330 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  27.6 
 
 		 290 aa  47  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 		 318 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 		 318 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 336 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1375  lysophospholipase  31.3 
 
 		 326 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  31.48 
 
 		 337 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  31.36 
 
 		 314 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 		 345 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 289 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 313 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 294 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  29.93 
 
 		 303 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0672  alpha/beta hydrolase superfamily protein  29.81 
 
 		 344 aa  45.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0529058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  27.61 
 
 		 263 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  28.26 
 
 		 319 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 291 aa  45.4  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  29.93 
 
 		 303 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  36.71 
 
 		 2762 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15580  alpha/beta hydrolase family protein  23.55 
 
 		 405 aa  45.4  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  31.9 
 
 		 317 aa  45.1  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  29.93 
 
 		 303 aa  45.1  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  32.58 
 
 		 291 aa  45.1  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 280 aa  45.1  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 295 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  33.08 
 
 		 318 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  30.08 
 
 		 280 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  30.08 
 
 		 280 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2844  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 369 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  26.09 
 
 		 300 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  28.57 
 
 		 292 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  29.06 
 
 		 408 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 337 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5256  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  27.16 
 
 		 634 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2058  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  25.55 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 		 305 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0078  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.455766  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  29.2 
 
 		 302 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1748  hypothetical protein  30.88 
 
 		 251 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  29.41 
 
 		 329 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3882  hypothetical protein  33.62 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 288 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0989794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 292 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0741  alpha/beta fold family hydrolase  29.63 
 
 		 263 aa  42.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00132598  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2482  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.601984 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  25.87 
 
 		 319 aa  42.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 		 305 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  28.29 
 
 		 292 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 329 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 287 aa  42.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6793  secreted protein  34.07 
 
 		 268 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 302 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  30.19 
 
 		 251 aa  42.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  26.28 
 
 		 319 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0279  transmembrane protein  33.88 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  31.62 
 
 		 415 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  26.96 
 
 		 325 aa  42.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1696  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  32.06 
 
 		 307 aa  42.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 279 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 		 291 aa  42.4  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 343 aa  42.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5597  putative alpha/beta superfamily hydrolase  44.44 
 
 		 237 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  23.49 
 
 		 312 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  23.49 
 
 		 312 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 		 301 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 302 aa  42  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>