23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1748 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1748  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  521  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  25.56 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  30 
 
 		 294 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  27.08 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  27 
 
 		 314 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  26.99 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  25 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.2 
 
 		 314 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  29.5 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 		 290 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.57 
 
 		 294 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  27.88 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  25.37 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  28.78 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  26.06 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2402  hypothetical protein  30.88 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2777  hypothetical protein  30.88 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.958453  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  24.68 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  25 
 
 		 295 aa  42.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  25 
 
 		 295 aa  42.4  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  25.45 
 
 		 287 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>