234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4361 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  100 
 
 		 137 aa  270  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  73.19 
 
 		 137 aa  199  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  75.91 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  72.46 
 
 		 137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  74.44 
 
 		 137 aa  197  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  73.68 
 
 		 137 aa  197  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  72.93 
 
 		 137 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  74.45 
 
 		 137 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  72.93 
 
 		 137 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  72.93 
 
 		 137 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  72.93 
 
 		 137 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  73.68 
 
 		 137 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  65.19 
 
 		 149 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  63.77 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  63.77 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  62.77 
 
 		 139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  62.41 
 
 		 137 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  62.32 
 
 		 140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  61.59 
 
 		 139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  61.59 
 
 		 139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  61.59 
 
 		 139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  60.29 
 
 		 141 aa  169  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  55.83 
 
 		 141 aa  144  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  56.67 
 
 		 141 aa  136  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  55.37 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  56.67 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  55.83 
 
 		 142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  55 
 
 		 143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  55 
 
 		 143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  54.17 
 
 		 143 aa  130  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  55.83 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  54.17 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  55 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  54.47 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  53.66 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  48.33 
 
 		 284 aa  124  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  53.33 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  50.41 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  52.5 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  52.03 
 
 		 147 aa  123  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  50.83 
 
 		 145 aa  123  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  53.33 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  52.5 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  50.79 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  50 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  52.5 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  49.17 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  50 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  49.17 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  47.76 
 
 		 261 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  48.33 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  46.28 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  48.33 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  48.33 
 
 		 246 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  50 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  48.33 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  48.33 
 
 		 243 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  48.33 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  48.33 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  45.45 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  42.5 
 
 		 279 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  45.45 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  43.33 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  45 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  45 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  42.15 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  42.28 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  42.74 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  45.53 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  41.8 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  41.67 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  43.17 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  42.4 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  45.83 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  44.26 
 
 		 138 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  43.09 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  39.02 
 
 		 146 aa  88.6  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  38.89 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  40.16 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  39.17 
 
 		 391 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  41.13 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  40.65 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  40.16 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0868  YCII-related protein  42.61 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5743  YCII-related protein  36.21 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  35.54 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  40.17 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  35.25 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0409  DGPFAETKE family protein  46.94 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00347395  normal  0.0963285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  34.71 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  35.2 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  38.79 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  37.61 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1334  DGPFAETKE family protein  38.14 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  37.61 
 
 		 114 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  37.61 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4225  DGPF domain-containing protein  36.52 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1068  YCII-related  32.54 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1007  DGPFAETKE domain-containing protein  34.13 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  31.15 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>