More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4032 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0368  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.76 
 
 		 601 aa  673    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.31 
 
 		 595 aa  903    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2639  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.81 
 
 		 595 aa  886    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601004  normal  0.257028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1571  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.67 
 
 		 601 aa  667    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000982993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0473  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  73.83 
 
 		 595 aa  922    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.390432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2330  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.63 
 
 		 595 aa  882    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1177  acyl-CoA dehydrogenase family protein  51.42 
 
 		 598 aa  646    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1337  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.83 
 
 		 601 aa  930    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0500  acyl-CoA dehydrogenase family protein  54.33 
 
 		 601 aa  664    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.837085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06620  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.93 
 
 		 598 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.63 
 
 		 595 aa  882    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06640  putative acyl-CoA dehydrogenase  54.76 
 
 		 592 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4681  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  54.59 
 
 		 601 aa  667    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.63 
 
 		 595 aa  882    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0419  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  83.56 
 
 		 596 aa  1048    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.232992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0446  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  73.83 
 
 		 595 aa  920    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0810  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  75.54 
 
 		 598 aa  949    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2750  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.26 
 
 		 599 aa  672    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000084613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.8 
 
 		 595 aa  885    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0695  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.8 
 
 		 595 aa  885    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06600  putative acyl-CoA dehydrogenase  54.92 
 
 		 601 aa  675    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5167  Acyl-CoA dehydrogenase-like  55.5 
 
 		 598 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5170  Acyl-CoA dehydrogenase-like  54.76 
 
 		 601 aa  673    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131109  normal  0.317042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4834  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.43 
 
 		 601 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.649579 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6048  Acyl-CoA dehydrogenase-like  70.81 
 
 		 599 aa  897    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.31 
 
 		 595 aa  903    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.440911  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0606  putative acyl-CoA dehydrogenase  54.76 
 
 		 601 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0564  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.8 
 
 		 595 aa  885    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.34 
 
 		 594 aa  644    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 596 aa  1231    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000200788 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0348  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  73.15 
 
 		 595 aa  907    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0680  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.8 
 
 		 595 aa  885    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3519  acyl-CoA dehydrogenase-like  72.7 
 
 		 598 aa  928    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1885  putative acyl-CoA dehydrogenase  53.43 
 
 		 595 aa  650    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0609  putative acyl-CoA dehydrogenase  54.59 
 
 		 592 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0592  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  76.05 
 
 		 598 aa  951    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.559108 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4081  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.76 
 
 		 601 aa  669    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.48 
 
 		 595 aa  908    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3957  acyl-CoA dehydrogenase-like  76.55 
 
 		 598 aa  973    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.574903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4445  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.76 
 
 		 626 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744679  normal  0.0140421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4038  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase  71.31 
 
 		 595 aa  896    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922091  normal  0.0585748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0578  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.98 
 
 		 595 aa  891    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0007  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.59 
 
 		 596 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.419421  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0571  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  76.21 
 
 		 598 aa  953    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2431  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  55.67 
 
 		 603 aa  658    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4089  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.5 
 
 		 601 aa  953    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0962  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.31 
 
 		 595 aa  898    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0385  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  73.99 
 
 		 595 aa  923    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13259 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2410  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.63 
 
 		 595 aa  882    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0105  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  58.51 
 
 		 612 aa  687    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0661  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  70.97 
 
 		 595 aa  895    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0398  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.76 
 
 		 601 aa  672    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1224  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.53 
 
 		 598 aa  923    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2109  acyl-CoA dehydrogenase-like  71.31 
 
 		 595 aa  903    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45920  acyl-CoA dehydrogenase  55.76 
 
 		 601 aa  669    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0363  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  73.83 
 
 		 595 aa  914    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3477  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.54 
 
 		 598 aa  956    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0394  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.76 
 
 		 601 aa  673    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2039  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.09 
 
 		 598 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1754  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.68 
 
 		 594 aa  658    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0420795 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0607  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.59 
 
 		 598 aa  661    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0370  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.85 
 
 		 592 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5166  Acyl-CoA dehydrogenase-like  53.77 
 
 		 592 aa  633  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0396  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.85 
 
 		 592 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.92 
 
 		 596 aa  631  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0912  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.83 
 
 		 597 aa  631  1e-179  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0400  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.76 
 
 		 592 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2768  acyl-CoA dehydrogenase family protein  52.59 
 
 		 596 aa  625  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0965  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.32 
 
 		 597 aa  627  1e-178  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.314138 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1308  Acyl-CoA dehydrogenase  53.92 
 
 		 596 aa  626  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135322  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0462  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.5 
 
 		 597 aa  625  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4832  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.18 
 
 		 592 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4079  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.76 
 
 		 592 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1452  acyl-CoA dehydrogenase-like  51.26 
 
 		 597 aa  622  1e-177  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2387  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.42 
 
 		 596 aa  623  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.109961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2552  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.59 
 
 		 596 aa  623  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0690519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01173  acyl-CoA dehydrogenase  52.84 
 
 		 597 aa  619  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520854  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2459  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.09 
 
 		 596 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09630  putative acyl-CoA dehydrogenase  52.09 
 
 		 593 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.806665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1408  acyl-CoA dehydrogenase-like  50.08 
 
 		 606 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3278  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.76 
 
 		 597 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3101  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.59 
 
 		 592 aa  610  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165418  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0506  acyl-CoA dehydrogenase family protein  51.93 
 
 		 592 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6066  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  52.95 
 
 		 598 aa  608  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0815  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.34 
 
 		 596 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.809407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4033  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.25 
 
 		 597 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0885  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.51 
 
 		 596 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.894915  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25210  acyl-CoA dehydrogenase  53.34 
 
 		 591 aa  607  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.885326  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2777  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.93 
 
 		 596 aa  604  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.932954  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0795  acyl-CoA dehydrogenase family protein  50.75 
 
 		 597 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4677  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  51.59 
 
 		 592 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0983724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0746  acyl-CoA dehydrogenase family protein  50.75 
 
 		 597 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.398029  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02316  Acyl-CoA dehydrogenase  49.42 
 
 		 599 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.254784  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5758  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.26 
 
 		 595 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3819  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.42 
 
 		 590 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2696  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.75 
 
 		 596 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1766  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.09 
 
 		 596 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439337  normal  0.311175 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2164  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.83 
 
 		 596 aa  600  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1726  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.25 
 
 		 596 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0737  acyl-CoA dehydrogenase-like  51.34 
 
 		 596 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.67515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>