More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1852 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  100 
 
 
410 aa  838    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  40 
 
 
407 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  37.06 
 
 
401 aa  223  6e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  34.75 
 
 
426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  37.81 
 
 
407 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  37.17 
 
 
400 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  34.96 
 
 
426 aa  199  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  36.41 
 
 
440 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  34 
 
 
445 aa  196  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  33.8 
 
 
421 aa  190  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  34.76 
 
 
413 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  35.98 
 
 
391 aa  186  8e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  35.28 
 
 
455 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  34.86 
 
 
437 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  32.31 
 
 
433 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  35.18 
 
 
433 aa  180  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  34.12 
 
 
415 aa  180  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  34.52 
 
 
405 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  33.85 
 
 
444 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  33.85 
 
 
430 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  33.86 
 
 
432 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  32.82 
 
 
411 aa  173  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  34.77 
 
 
444 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  34.49 
 
 
419 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  33.87 
 
 
412 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  30.67 
 
 
459 aa  170  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  34.26 
 
 
408 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  34.26 
 
 
408 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  34.26 
 
 
408 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  34.58 
 
 
441 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  33.33 
 
 
430 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  34.68 
 
 
431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  34.78 
 
 
428 aa  166  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  32.11 
 
 
407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  32.19 
 
 
431 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  31.94 
 
 
402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  32.66 
 
 
423 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  32.36 
 
 
434 aa  163  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  32.12 
 
 
403 aa  163  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  31.47 
 
 
433 aa  163  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  33.85 
 
 
402 aa  162  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  32.3 
 
 
404 aa  163  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  32.53 
 
 
436 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  32.75 
 
 
423 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  31.02 
 
 
438 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  35.41 
 
 
426 aa  159  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  32.5 
 
 
423 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  30.75 
 
 
428 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  33.33 
 
 
416 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  29.58 
 
 
405 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  32.21 
 
 
417 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  32.21 
 
 
417 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  30.73 
 
 
414 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  32.21 
 
 
417 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  30.37 
 
 
429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  29.67 
 
 
396 aa  152  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  26.96 
 
 
438 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  32.53 
 
 
422 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  30.02 
 
 
417 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  31.03 
 
 
413 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  31.03 
 
 
413 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  32.21 
 
 
461 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.06 
 
 
426 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  31.03 
 
 
420 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  29.03 
 
 
418 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  29.54 
 
 
408 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  31.3 
 
 
413 aa  150  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  29.29 
 
 
425 aa  149  9e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  32.98 
 
 
422 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  30.73 
 
 
407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  31.77 
 
 
421 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  33.85 
 
 
444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  30.23 
 
 
445 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  29.49 
 
 
431 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  29.89 
 
 
448 aa  147  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  30.26 
 
 
411 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  28.53 
 
 
412 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  30.57 
 
 
424 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  31.15 
 
 
419 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  31.84 
 
 
409 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  29.92 
 
 
409 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  31.15 
 
 
419 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  29.92 
 
 
409 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  29.92 
 
 
409 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  30.23 
 
 
403 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  28.27 
 
 
412 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  32.03 
 
 
412 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  26.54 
 
 
443 aa  137  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  30.19 
 
 
390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  31.29 
 
 
405 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  28.27 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  30.21 
 
 
409 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  29.41 
 
 
407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  27.68 
 
 
470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  30.89 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  30.75 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  29.22 
 
 
415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  28.44 
 
 
409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  28.3 
 
 
406 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  27.97 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>