More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0594 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0594  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
224 aa  457  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0561  phosphate uptake regulator, PhoU  54.82 
 
 
228 aa  257  1e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1876  phosphate uptake regulator, PhoU  41.67 
 
 
217 aa  181  6e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  40.28 
 
 
218 aa  177  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0987  phosphate transport system regulatory protein PhoU  41.2 
 
 
217 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.188055  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0552  phosphate uptake regulator  36.87 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5092700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1564  phosphate uptake regulator, PhoU  36.07 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.416794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  36.97 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  36.11 
 
 
217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  36.11 
 
 
217 aa  134  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 
229 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  31.46 
 
 
220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  30.48 
 
 
225 aa  118  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  31.94 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  31.94 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  32.72 
 
 
217 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 
219 aa  111  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  31.73 
 
 
222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  32.72 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  29.49 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  29.81 
 
 
241 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 
220 aa  108  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  29.91 
 
 
219 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 
218 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 
216 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  28.7 
 
 
216 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  31.25 
 
 
240 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.37 
 
 
235 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 
243 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  29.3 
 
 
229 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4447  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 
234 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0784  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.7 
 
 
234 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.7 
 
 
234 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  30.95 
 
 
223 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.7 
 
 
234 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.7 
 
 
234 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.7 
 
 
234 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 
215 aa  105  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.7 
 
 
234 aa  105  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1489  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.7 
 
 
234 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  31.92 
 
 
240 aa  104  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 
232 aa  104  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.7 
 
 
234 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1511  phosphate uptake regulator, PhoU  32.21 
 
 
232 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1598  phosphate uptake regulator, PhoU  30.14 
 
 
235 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  30.95 
 
 
223 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7239  phosphate uptake regulator, PhoU  29.77 
 
 
235 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  0.639643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  27.83 
 
 
242 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30 
 
 
228 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  31.02 
 
 
219 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  30.14 
 
 
242 aa  102  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  30.92 
 
 
227 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  31.94 
 
 
234 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  31.94 
 
 
234 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  31.94 
 
 
234 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0265  phosphate uptake regulator, PhoU  27.05 
 
 
237 aa  102  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  31.4 
 
 
228 aa  102  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  29.56 
 
 
253 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  30.43 
 
 
233 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  30.23 
 
 
234 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0483  phosphate uptake regulator, PhoU  29.25 
 
 
216 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  30.92 
 
 
237 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  29.56 
 
 
253 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  31.48 
 
 
234 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 
222 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1560  phosphate uptake regulator, PhoU  30.77 
 
 
232 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 
223 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1181  phosphate uptake regulator, PhoU  31.48 
 
 
234 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  30.43 
 
 
233 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  31.4 
 
 
237 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  29.52 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  29.6 
 
 
226 aa  99.4  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  30.37 
 
 
223 aa  99.4  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  30.37 
 
 
223 aa  99.4  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  31.53 
 
 
242 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  31.03 
 
 
242 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  30.58 
 
 
234 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  30.95 
 
 
234 aa  99  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  30.48 
 
 
234 aa  99  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  31.48 
 
 
218 aa  99  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  27.96 
 
 
242 aa  98.6  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  30.29 
 
 
236 aa  98.6  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  30.92 
 
 
237 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  28.71 
 
 
233 aa  98.2  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  30.81 
 
 
238 aa  98.6  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  30.58 
 
 
234 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0310  phosphate uptake regulator, PhoU  29.49 
 
 
218 aa  98.2  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.368967  normal  0.0297359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  28.85 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  27.14 
 
 
237 aa  97.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  27.96 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  28.85 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  28.85 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  31.48 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  27.96 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  28.85 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  28.85 
 
 
241 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  26.64 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  31.1 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>