61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0495 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0495  ribonuclease BN-like family protein  100 
 
 
286 aa  569  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.582599  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  26.77 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0632  ribonuclease BN-like family protein  28.68 
 
 
301 aa  93.2  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1576  ribonuclease BN-like family protein  26.64 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  25.68 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  25 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0847  ribonuclease BN, putative  24.44 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  25 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0701  ribonuclease BN-like family protein  23.37 
 
 
307 aa  67  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  24.25 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  24.3 
 
 
310 aa  62.4  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  23.36 
 
 
289 aa  62.4  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1515  ribonuclease BN-like family protein  24.27 
 
 
314 aa  60.1  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  25.7 
 
 
374 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  22.54 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  23.87 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  22.54 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  22.54 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  22.54 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  22.54 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  22.54 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  25.39 
 
 
277 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  24.43 
 
 
316 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  27.53 
 
 
320 aa  52.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  22.26 
 
 
276 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  22.27 
 
 
318 aa  52.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  23.87 
 
 
377 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  21.79 
 
 
359 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  25.97 
 
 
317 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  25.63 
 
 
484 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  22.63 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  23.05 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  26.05 
 
 
328 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  23.65 
 
 
323 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  25 
 
 
322 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  24.89 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  25.48 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  25.19 
 
 
401 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  27.46 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  21.08 
 
 
321 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  23.25 
 
 
367 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  21.76 
 
 
405 aa  46.6  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  23.05 
 
 
386 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  25.79 
 
 
285 aa  46.6  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  25.45 
 
 
338 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1095  hypothetical protein  23.18 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.377246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  25.54 
 
 
341 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  24.11 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  26.83 
 
 
338 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  26.83 
 
 
338 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1887  hypothetical protein  21.89 
 
 
433 aa  43.5  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.321613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  23.56 
 
 
319 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  21.63 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  26.82 
 
 
386 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  22.26 
 
 
388 aa  42.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  23.56 
 
 
318 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  21.85 
 
 
318 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  22.26 
 
 
388 aa  42.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  21.86 
 
 
363 aa  42.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  23.56 
 
 
318 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  25.64 
 
 
328 aa  42.4  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>