81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1949 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1949  di- or tricarboxylate transporter  100 
 
 		 392 aa  778    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00031029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  32.96 
 
 		 383 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  32.96 
 
 		 383 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  33.43 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2095  putative transporter  33.43 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2909  transporter  33.33 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.204967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3166  putative transporter  33.33 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3173  putative transporter  33.52 
 
 		 383 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.745852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2859  transporter  32.69 
 
 		 409 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.265572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1874  citrate transporter  32.25 
 
 		 377 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870467  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0077  di- and tricarboxylate transporter  30.37 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154883  normal  0.998926 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0595  di- and tricarboxylate transporter  28.46 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3520  Citrate transporter  32.94 
 
 		 374 aa  157  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000961964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3129  citrate transporter  30.17 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.246897  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13780  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  29.26 
 
 		 360 aa  140  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1042  citrate transporter  26.04 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0236  Citrate transporter  26.97 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0898  putative di-/tri-carboxylate transporter  26.9 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.878085  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  26.77 
 
 		 378 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  29.35 
 
 		 366 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  27.33 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3977  transporter, putative  28.65 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  27.04 
 
 		 377 aa  96.7  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  26.98 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  28.21 
 
 		 377 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  26.1 
 
 		 378 aa  93.2  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  28.7 
 
 		 377 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0876  citrate transporter family protein  28.71 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0967  citrate transporter family protein  28.71 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  25.22 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4051  transporter, putative  28.61 
 
 		 377 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0186  transporter, putative  28.61 
 
 		 383 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0404913  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0934  citrate transporter family protein  28.71 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0904  citrate transporter family protein  28.39 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  26.32 
 
 		 372 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3007  putative transporter  28.32 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  26.32 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1595  putative transporter  28.32 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2948  transporter, putative  28.32 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  26.32 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3363  putative transporter  28.32 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431156  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  26.32 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  25.29 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  25.29 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1105  transmembrane protein  24.93 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  24.62 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  24.62 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  25.76 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1354  Citrate transporter  31.6 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0783517  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  25.31 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  35.4 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  34.51 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  34.51 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  34.51 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  34.51 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  23.12 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  21.67 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  24.23 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  21.41 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  22.74 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  26.83 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  22.58 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  23.81 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  24.68 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  24.34 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  25.47 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  24.81 
 
 		 425 aa  49.7  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  22.77 
 
 		 419 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  20.71 
 
 		 424 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  23.53 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  21.85 
 
 		 436 aa  46.6  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  22.4 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  24.1 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  29.2 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  22.38 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  25.93 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  29.2 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  29.2 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  23.14 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  22.7 
 
 		 417 aa  43.5  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  21.68 
 
 		 431 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>