266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1858 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1858  amidase  100 
 
 
206 aa  425  1e-118  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000146325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4572  isochorismatase hydrolase  56.5 
 
 
212 aa  256  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333323  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_003296  RS01788  hypothetical protein  59 
 
 
212 aa  254  7e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.688717  normal  0.622692 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4267  isochorismatase hydrolase  58.5 
 
 
213 aa  249  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.450558  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3473  isochorismatase hydrolase  58 
 
 
212 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0622536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4314  isochorismatase hydrolase  58 
 
 
212 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4052  isochorismatase hydrolase  58 
 
 
212 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2192  isochorismatase hydrolase  56 
 
 
213 aa  247  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338623  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4681  isochorismatase hydrolase  57 
 
 
213 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0242  isochorismatase  57 
 
 
347 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3097  isochorismatase hydrolase  42.55 
 
 
216 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.671486  normal  0.266258 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3175  isochorismatase family protein  45.16 
 
 
214 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3152  isochorismatase family protein  45.16 
 
 
214 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3161  isochorismatase family protein  45.16 
 
 
214 aa  168  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2917  isochorismatase  45.16 
 
 
214 aa  168  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2088  isochorismatase family protein  45.16 
 
 
214 aa  168  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2943  isochorismatase family protein  45.16 
 
 
214 aa  168  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3167  isochorismatase family protein  45.16 
 
 
214 aa  168  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.248835  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5720  isochorismatase hydrolase  40.53 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2690  hypothetical protein  42.02 
 
 
217 aa  161  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3014  hydrolase  43.5 
 
 
209 aa  161  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.446306  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0106  isochorismatase hydrolase  41.84 
 
 
221 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1435  isochorismatase hydrolase  41.36 
 
 
213 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.544565  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2389  putative isochorismatase hydrolase  39.79 
 
 
211 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551165  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1343  isochorismatase family protein  40.86 
 
 
217 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1916  isochorismatase hydrolase  40.44 
 
 
217 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1678  isochorismatase hydrolase  40.11 
 
 
217 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1103  isochorismatase hydrolase  39.57 
 
 
218 aa  156  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0521  isochorismatase hydrolase  40.72 
 
 
220 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.592648  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2390  isochorismatase hydrolase  40.54 
 
 
216 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2374  isochorismatase hydrolase  41.24 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0229134  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1997  isochorismatase hydrolase  39.04 
 
 
217 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6133  isochorismatase hydrolase  37.7 
 
 
211 aa  151  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.807443  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0188  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
216 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5596  putative isochorismatase family protein  39.46 
 
 
216 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.247182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1338  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781406  normal  0.20324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4536  isochorismatase hydrolase  38.07 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4813  isochorismatase hydrolase  38.74 
 
 
216 aa  144  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5311  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 
228 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.652401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1920  isochorismatase hydrolase  39.68 
 
 
208 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2382  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 
234 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.78279  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2662  isochorismatase hydrolase  36.55 
 
 
228 aa  141  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.813771  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3976  isochorismatase superfamily hydrolase  37.56 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.137258 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0242  putative hydrolase protein  36.04 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1858  isochorismatase hydrolase  38.38 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0263508 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1270  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5810  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209383  normal  0.669333 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1304  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5594  isochorismatase hydrolase  37.06 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247048  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3973  putative hydrolase  36.46 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.289869  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0911  isochorismatase hydrolase  36.55 
 
 
228 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1393  isochorismatase hydrolase  36.55 
 
 
228 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.248443  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1371  isochorismatase hydrolase  36.55 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.081167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1914  isochorismatase hydrolase  35.94 
 
 
232 aa  138  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29240  putative hydrolase  35.94 
 
 
226 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7008  isochorismatase hydrolase  36.04 
 
 
228 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0101515 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0594  isochorismatase superfamily hydrolase  36.46 
 
 
228 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1985  isochorismatase superfamily hydrolase  36.98 
 
 
340 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471326  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0687  isochorismatase superfamily hydrolase  36.46 
 
 
284 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1487  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 
228 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6342  isochorismatase hydrolase  35.53 
 
 
228 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4727  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 
232 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2336  isochorismatase hydrolase  37.14 
 
 
218 aa  133  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0186  hypothetical protein  36.04 
 
 
235 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348065  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4848  isochorismatase hydrolase  34.01 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2298  isochorismatase hydrolase  38.24 
 
 
210 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155249  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1666  isochorismatase hydrolase  36.87 
 
 
229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152838  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4075  isochorismatase hydrolase  37.37 
 
 
229 aa  128  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5153  isochorismatase hydrolase  38.24 
 
 
208 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5243  isochorismatase superfamily hydrolase  38.24 
 
 
208 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0711  isochorismatase superfamily hydrolase  35.42 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.175294  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0745  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3504  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0229  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  34.92 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4472  isochorismatase hydrolase  34.9 
 
 
206 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1558  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 
232 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0749  isochorismatase hydrolase  34.9 
 
 
206 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3974  isochorismatase hydrolase  39.36 
 
 
218 aa  124  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1233  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 
235 aa  123  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.526213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1009  isochorismatase family protein  37.06 
 
 
208 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4273  isochorismatase hydrolase  35.23 
 
 
229 aa  123  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1779  isochorismatase hydrolase  34.41 
 
 
208 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31440  hydrolase, isochorismatase family  36.47 
 
 
215 aa  121  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286068  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5472  isochorismatase hydrolase  36.98 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0973  isochorismatase hydrolase family protein  33.85 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1916  isochorismatase hydrolase  35.09 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5248  isochorismatase superfamily hydrolase  33.85 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0218  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1967  isochorismatase hydrolase  35.88 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  34.04 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2840  putative hydrolase  36.36 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5158  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283846  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33420  putative hydrolase  36.36 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.0254919 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2583  isochorismatase family protein  32.29 
 
 
210 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0322  isochorismatase hydrolase  35.94 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0166025  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2223  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.665514 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3570  isochorismatase hydrolase  33.91 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411732  normal  0.268452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1059  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2301  isochorismatase hydrolase  35.29 
 
 
224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167254  hitchhiker  0.00473367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>