68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0316 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  819    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  51.52 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  32.96 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  29.83 
 
 		 402 aa  153  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  37.98 
 
 		 341 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  34.48 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  32.96 
 
 		 390 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  29.22 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  31.37 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  29.02 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  37.93 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  26.18 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  28.72 
 
 		 397 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  32.58 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  28.13 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  31.33 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  31.33 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  27.09 
 
 		 406 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  32.94 
 
 		 345 aa  106  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  31.68 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  28.16 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  32.53 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  29.22 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  34.25 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  29.22 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  28.31 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  26.67 
 
 		 349 aa  100  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  27.7 
 
 		 378 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  36.22 
 
 		 458 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  29.78 
 
 		 366 aa  98.6  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  28.45 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  31.69 
 
 		 375 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  29.41 
 
 		 353 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  33.69 
 
 		 617 aa  92.8  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  31.32 
 
 		 539 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  27.43 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  32.99 
 
 		 638 aa  92.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  30.41 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  23.7 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  27 
 
 		 409 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  25.89 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  28.12 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  31.46 
 
 		 650 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  28.1 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  31.55 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  24.76 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  28.27 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  30.27 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  32.24 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  28.11 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  29.03 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  28.88 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  27.43 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  35 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  23.81 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  25.13 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  23.29 
 
 		 363 aa  53.9  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  30.58 
 
 		 522 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  32.95 
 
 		 575 aa  50.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4780  hypothetical protein  26.04 
 
 		 168 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  25.79 
 
 		 589 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  31.06 
 
 		 320 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  28.74 
 
 		 575 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4280  hypothetical protein  28.75 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  28.72 
 
 		 570 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  26.37 
 
 		 221 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  26.37 
 
 		 221 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>