More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23630 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  100 
 
 		 386 aa  749    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  51.94 
 
 		 414 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0076  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  53.57 
 
 		 408 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  50 
 
 		 386 aa  309  6.999999999999999e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0459  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  48.75 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  49.49 
 
 		 359 aa  280  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  34.22 
 
 		 785 aa  207  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  35.7 
 
 		 760 aa  199  5e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  33.85 
 
 		 788 aa  199  5e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  33.89 
 
 		 754 aa  196  6e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  36.89 
 
 		 799 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  32.2 
 
 		 769 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 780 aa  190  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  32.1 
 
 		 785 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  30.07 
 
 		 758 aa  186  5e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  32.87 
 
 		 761 aa  186  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  33.41 
 
 		 762 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  36.18 
 
 		 758 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  31.52 
 
 		 761 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  36.73 
 
 		 758 aa  182  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  32.94 
 
 		 758 aa  180  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  33.25 
 
 		 762 aa  177  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  38.62 
 
 		 810 aa  176  9e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  33.41 
 
 		 765 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  33.41 
 
 		 824 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  35.91 
 
 		 812 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  36.34 
 
 		 809 aa  172  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  33.84 
 
 		 764 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  32.63 
 
 		 758 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  37.65 
 
 		 809 aa  170  4e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  31.48 
 
 		 779 aa  170  5e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  32.93 
 
 		 758 aa  169  9e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  32.84 
 
 		 757 aa  167  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  32.08 
 
 		 781 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  34.82 
 
 		 782 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2434  Pyruvate, water dikinase  35.57 
 
 		 434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  33.23 
 
 		 758 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.88 
 
 		 810 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  31.53 
 
 		 794 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  33.06 
 
 		 789 aa  153  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  34.12 
 
 		 794 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  32.78 
 
 		 789 aa  152  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  32.78 
 
 		 789 aa  152  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  32.78 
 
 		 789 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  32.78 
 
 		 789 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  32.78 
 
 		 789 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  32.78 
 
 		 789 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  32.78 
 
 		 789 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  33.82 
 
 		 794 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  34.02 
 
 		 760 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  33.7 
 
 		 784 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  32.43 
 
 		 786 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  34.43 
 
 		 801 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  33.24 
 
 		 800 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  32.65 
 
 		 801 aa  149  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  33.42 
 
 		 796 aa  149  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  34.12 
 
 		 800 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  34.12 
 
 		 800 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  34.12 
 
 		 799 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  34.12 
 
 		 800 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  34.12 
 
 		 799 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  33.53 
 
 		 800 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  32.51 
 
 		 791 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  33.53 
 
 		 801 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  32.97 
 
 		 792 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  32.97 
 
 		 799 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  32.97 
 
 		 799 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  32.97 
 
 		 798 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  32.97 
 
 		 812 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  32.97 
 
 		 799 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  32.97 
 
 		 799 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  31.13 
 
 		 789 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  32.97 
 
 		 799 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  32.97 
 
 		 799 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  30.79 
 
 		 790 aa  146  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  33.43 
 
 		 799 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  33.82 
 
 		 795 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.18 
 
 		 887 aa  145  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  33.52 
 
 		 789 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  32.16 
 
 		 799 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  32.16 
 
 		 801 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  34.33 
 
 		 793 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2715  phosphoenolpyruvate synthase  31.69 
 
 		 789 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000237182  hitchhiker  0.00109533 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  32.88 
 
 		 795 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  32.72 
 
 		 799 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  34.99 
 
 		 806 aa  143  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  32.35 
 
 		 792 aa  142  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  36.88 
 
 		 902 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  29.35 
 
 		 805 aa  142  9e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  32.98 
 
 		 803 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  33.72 
 
 		 792 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  33.24 
 
 		 795 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  32.6 
 
 		 795 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  36.77 
 
 		 868 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  32.14 
 
 		 797 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  32.08 
 
 		 792 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  33.82 
 
 		 792 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  32.08 
 
 		 792 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  32.08 
 
 		 792 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  32.65 
 
 		 803 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>