More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23560 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 138 aa  276  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  60.47 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  55.15 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  58.41 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  43.2 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  50.46 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  44.88 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  44.25 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  47.79 
 
 		 126 aa  94.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  46.77 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  40.46 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  50.98 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  47.41 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  49.02 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  44.92 
 
 		 119 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  46.09 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  44.34 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  42.2 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 113 aa  83.6  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  37.6 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  38.68 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  56.72 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  38.79 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  46.6 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  46.38 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  32.52 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  32.52 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  37.25 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  31.71 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  51.43 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  50.72 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  50.75 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  39.5 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  50.75 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  41.38 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5255  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107337  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 391 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  40 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6346  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  32.81 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0677  MerR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00486381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6614  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  34.17 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 		 334 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 162 aa  57  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2454  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.589296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4396  transcriptional regulator, MerR family  34.55 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4286  transcriptional regulator, MerR family  34.55 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  37.62 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2902  regulatory protein, MerR  33.33 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  30.08 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5683  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6047  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.790418 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  36.28 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  33.09 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1699  MerR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00675025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2702  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  33.09 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>