More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20760 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_20760  LSU ribosomal protein L24P  100 
 
 		 119 aa  232  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2964  50S ribosomal protein L24  64.96 
 
 		 119 aa  143  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00916066  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  59.38 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2676  50S ribosomal protein L24  64.1 
 
 		 120 aa  140  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  59.83 
 
 		 113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0699  50S ribosomal protein L24  58.87 
 
 		 123 aa  124  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  55.56 
 
 		 113 aa  124  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  59.48 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  48.76 
 
 		 108 aa  103  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3132  50S ribosomal protein L24  59.83 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  51.69 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  48.76 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0598  ribosomal protein L24  50.93 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  49.15 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  49.15 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  49.15 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  46.96 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  45.76 
 
 		 105 aa  93.6  9e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  44.35 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  44.35 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  45.76 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  44.35 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  44.35 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  44.35 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  44.35 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  44.35 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  44.35 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  44.35 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29630  LSU ribosomal protein L24P  53 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.750571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  47.46 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1718  50S ribosomal protein L24  46.96 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  44.35 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  49.15 
 
 		 106 aa  91.7  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  44.35 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  44.26 
 
 		 114 aa  90.1  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0942  50S ribosomal protein L24  48.44 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  49.15 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  46.61 
 
 		 104 aa  86.7  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  45.76 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  40.87 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  48.89 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  44.92 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  46.32 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  44.35 
 
 		 101 aa  83.6  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  45.05 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  45.22 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  44.83 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  40.87 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  40.87 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  43.22 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  42.11 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  38.98 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  49.43 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  47.41 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  43.22 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  42.11 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  44.14 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  40.68 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  45.36 
 
 		 103 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  43.33 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  43.33 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  46.59 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  41.74 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  39.66 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  47.13 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  45.97 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  42.22 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1097  Ribosomal protein L24-like protein  49.38 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  45.74 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  44.32 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  37.93 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  37.93 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  40.35 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  38.98 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  46.51 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  43.75 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1118  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  44.21 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  43.18 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  37.29 
 
 		 105 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  44.68 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  41.23 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  40.78 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  48.35 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  40.52 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  40 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  41.11 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  44.19 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  41.59 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  43.48 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  44.09 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  48.39 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  38.14 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0573  50S ribosomal protein L24  48.15 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  43.96 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  40.54 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  43.33 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>