More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2054 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 107 aa  216  7e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  66.36 
 
 		 107 aa  156  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  64.49 
 
 		 107 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  65.09 
 
 		 107 aa  148  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  59.62 
 
 		 109 aa  142  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  61.82 
 
 		 110 aa  140  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  54.72 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 109 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  59.22 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  59.22 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  55.14 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  55.14 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 103 aa  114  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 103 aa  113  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 103 aa  113  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  52.38 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  53.77 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 101 aa  104  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 106 aa  103  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  103  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1357  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00374615  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  49.06 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  49.06 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4265  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655615  unclonable  0.00000000000267825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4306  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000126624  unclonable  0.0000000000482395 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  48.6 
 
 		 106 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0169  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000484148  hitchhiker  0.000323291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 100 aa  98.6  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0637  ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000374833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  47.62 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0195  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000100309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4537  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407127  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0848  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08960  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786471  normal  0.0497722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3327  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 105 aa  98.2  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000922916  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0207  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000541259  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2313  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 105 aa  98.2  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000126749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4045  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000115284  unclonable  0.00000000000347385 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4159  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000135344  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06360  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0211  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000151512  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0691  50S ribosomal protein L24  47.62 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0465  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451517  hitchhiker  0.00000267089 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2313  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.103377  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4738  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0127139  normal  0.762072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0498  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000033533  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0495  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2361  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.449778  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3748  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000844667  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0181  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000129578  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0276  50S ribosomal protein L24  53.27 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000858967  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0224  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000086996  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0242  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5068  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000162639  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3898  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00126984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0970  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000143141  hitchhiker  0.000000947265 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0210  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216375  unclonable  0.0000000000129617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0205  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0210  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  45.37 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4679  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 104 aa  94.4  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000175822  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0159  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000158735  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1407  ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  45.37 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0432  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0323669  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0730  ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00351151  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  41.75 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04510  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0040022  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3811  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  47.06 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3513  ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000647333  hitchhiker  0.0000000884976 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0404  ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002398  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3796  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3733  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.012207  normal  0.015742 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3625  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000301612  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0416  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000325696  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3698  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000743122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3792  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>