More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0944 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 108 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 108 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  72.22 
 
 		 109 aa  167  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  72.22 
 
 		 108 aa  159  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  68.52 
 
 		 108 aa  158  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1357  50S ribosomal protein L24  61.68 
 
 		 108 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00374615  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0691  50S ribosomal protein L24  61.11 
 
 		 108 aa  134  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  57.8 
 
 		 109 aa  125  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  60.58 
 
 		 106 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  57.41 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 103 aa  120  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 109 aa  120  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  57.69 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  57.69 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  59.22 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  53.7 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  52.29 
 
 		 116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 105 aa  110  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 103 aa  110  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1407  ribosomal protein L24  51.52 
 
 		 101 aa  106  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  58.42 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  50.5 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 106 aa  103  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 		 107 aa  103  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  50 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  49.09 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  49.09 
 
 		 110 aa  100  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  46 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  48.18 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  46 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  45 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 115 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  46.85 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  43 
 
 		 105 aa  93.6  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  42 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  47 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  43 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  46.53 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  49.53 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  46 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  43 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 108 aa  90.5  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  41 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  42 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0878  50S ribosomal protein L24  50.47 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0510214  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  42 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  43 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  42 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  42 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  41 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>