More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2700 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 106 aa  207  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  71.84 
 
 		 103 aa  146  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  71.84 
 
 		 103 aa  146  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  71.84 
 
 		 103 aa  146  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  71.84 
 
 		 103 aa  146  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  71.84 
 
 		 103 aa  146  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  71.84 
 
 		 103 aa  146  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  71.84 
 
 		 103 aa  146  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  71.84 
 
 		 103 aa  146  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  71.84 
 
 		 103 aa  146  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  71.84 
 
 		 103 aa  146  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  70.87 
 
 		 103 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  72.82 
 
 		 103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  68.93 
 
 		 103 aa  140  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  63.11 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  61.17 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  61.17 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  67.33 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  66 
 
 		 105 aa  131  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  66 
 
 		 105 aa  131  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 106 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 104 aa  130  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  59.22 
 
 		 104 aa  130  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 106 aa  129  9e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 105 aa  129  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  59.09 
 
 		 110 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  56.6 
 
 		 106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  61.9 
 
 		 105 aa  128  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  59.62 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  60.91 
 
 		 118 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  62.75 
 
 		 102 aa  127  7.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  64 
 
 		 105 aa  126  8.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 		 105 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  67.92 
 
 		 106 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 105 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 106 aa  123  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 107 aa  123  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 109 aa  123  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 105 aa  123  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  56.86 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  54.63 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 		 105 aa  120  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  55.24 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 111 aa  120  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  55.24 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  62.14 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  56.6 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  55.14 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04510  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 105 aa  116  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0040022  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 104 aa  116  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0505  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0612161  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  61.17 
 
 		 101 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  54.21 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2313  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 105 aa  114  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000126749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 104 aa  114  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  59.22 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 104 aa  113  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 102 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2313  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.103377  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  54.35 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  54.13 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  55.05 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  63.73 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0444  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0162317  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  53.21 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 104 aa  111  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  54.05 
 
 		 110 aa  110  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  53.77 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 		 116 aa  110  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  56.73 
 
 		 109 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>