More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0997 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 103 aa  199  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  80.58 
 
 		 103 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  86.41 
 
 		 102 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  85.44 
 
 		 102 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  78.64 
 
 		 103 aa  168  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  85.44 
 
 		 102 aa  168  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  77.67 
 
 		 103 aa  167  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  78.85 
 
 		 104 aa  165  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  81.37 
 
 		 105 aa  163  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  75 
 
 		 104 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  75 
 
 		 104 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  78.43 
 
 		 105 aa  159  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  78.43 
 
 		 105 aa  159  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  78.43 
 
 		 105 aa  158  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  80.43 
 
 		 105 aa  147  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  74.51 
 
 		 104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  74.51 
 
 		 104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  75.49 
 
 		 104 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  75.49 
 
 		 104 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  73.53 
 
 		 104 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  72.55 
 
 		 104 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  73.53 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  72.55 
 
 		 104 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  75.49 
 
 		 104 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  72.55 
 
 		 104 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  63.73 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  67.65 
 
 		 104 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  69 
 
 		 104 aa  124  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  124  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  124  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  124  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  124  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  123  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  121  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 		 104 aa  120  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  68.63 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 106 aa  117  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  60.61 
 
 		 101 aa  116  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2523  50S ribosomal protein L24  57.58 
 
 		 101 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1726  50S ribosomal protein L24  57.58 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267784  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0372  50S ribosomal protein L24  57.58 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 103 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  56.57 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  56.57 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  53 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  55.56 
 
 		 101 aa  110  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  56.57 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0602  50S ribosomal protein L24  57.58 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  51.96 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 106 aa  106  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0237  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 109 aa  103  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  50 
 
 		 112 aa  102  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  57.14 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  48.48 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  51.52 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0265  50S ribosomal protein L24  53.54 
 
 		 101 aa  100  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0644649  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 106 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0670  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077767  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  45.36 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  48 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0420  50S ribosomal protein L24  48.6 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.177045  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0848  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08960  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786471  normal  0.0497722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>