More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3714 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 119 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  78.45 
 
 		 117 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  78.45 
 
 		 117 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  78.15 
 
 		 122 aa  180  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  80.77 
 
 		 115 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  78.85 
 
 		 117 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  77.88 
 
 		 115 aa  170  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  75.73 
 
 		 113 aa  162  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19921  50S ribosomal protein L24  60.34 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23131  50S ribosomal protein L24  63.46 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1118  50S ribosomal protein L24  59.48 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1966  50S ribosomal protein L24  60.58 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  58.65 
 
 		 118 aa  133  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16671  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 103 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17541  50S ribosomal protein L24  56.73 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1639  50S ribosomal protein L24  56.73 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17291  50S ribosomal protein L24  53.78 
 
 		 118 aa  123  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17381  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 118 aa  123  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  49.11 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  55.45 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 106 aa  107  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  48.6 
 
 		 107 aa  107  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17263  Plastid ribosomal protein L24 large ribosomal subunit  57.84 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00177842  decreased coverage  0.00283524 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  53.64 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 108 aa  103  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 104 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  48.08 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  47.66 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1274  ribosomal protein L24  45.24 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  48.6 
 
 		 109 aa  97.1  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 105 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  49 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 		 104 aa  94.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1563  ribosomal protein L24  54.81 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00170276  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  47.66 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 105 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  44.86 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  46.79 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  42.72 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  44.95 
 
 		 118 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  45.87 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  49.53 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 106 aa  91.7  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  49.53 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  45.28 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  46 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  43.56 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 106 aa  90.1  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  43.56 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>