More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0638 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  100 
 
 		 113 aa  216  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  81.42 
 
 		 113 aa  184  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0598  ribosomal protein L24  70 
 
 		 116 aa  156  8e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29630  LSU ribosomal protein L24P  80.21 
 
 		 116 aa  154  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.750571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3132  50S ribosomal protein L24  73.91 
 
 		 115 aa  148  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2964  50S ribosomal protein L24  64.71 
 
 		 119 aa  141  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00916066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2676  50S ribosomal protein L24  62.71 
 
 		 120 aa  139  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  60.18 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  61.06 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0699  50S ribosomal protein L24  59.02 
 
 		 123 aa  118  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  56.35 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0942  50S ribosomal protein L24  57.63 
 
 		 122 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1718  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 		 111 aa  113  7.999999999999999e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20760  LSU ribosomal protein L24P  57.76 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  52.73 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  50.91 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  51.35 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  52.73 
 
 		 104 aa  103  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  51.82 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  47.27 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  49.09 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  48.18 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  48.18 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  51.33 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  47.27 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  46.36 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  46.36 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  46.36 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  50.43 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  49.55 
 
 		 106 aa  93.6  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  48.18 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  47.32 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  48.18 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  49.55 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  49.55 
 
 		 105 aa  90.9  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  49.55 
 
 		 105 aa  90.9  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  51.82 
 
 		 101 aa  90.5  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  49.09 
 
 		 101 aa  88.6  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  48.62 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  48.65 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  51.11 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  46.36 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  46.36 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  47.22 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  46.36 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  47.66 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  47.32 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 		 103 aa  85.5  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  47.27 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  48.21 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  51.79 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  46.73 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  45.37 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  46.3 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  50.57 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0778  ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000331203  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  45.05 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  47.27 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0334  ribosomal protein L24  50 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000366107  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  46.79 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3898  50S ribosomal protein L24  46.9 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00126984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0306  ribosomal protein L24  43.36 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0004461  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  49.55 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  47.37 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  49.11 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  48.21 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2361  50S ribosomal protein L24  57.3 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.449778  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  42.73 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  46.36 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  45.13 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2313  50S ribosomal protein L24  53.41 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.103377  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0848  50S ribosomal protein L24  45.13 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  41.82 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08960  50S ribosomal protein L24  45.13 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786471  normal  0.0497722 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  46.85 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5059  50S ribosomal protein L24  50.44 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  46.36 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  48.18 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  49.09 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  47.19 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>