More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3894 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 123 aa  235  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0942  50S ribosomal protein L24  59.17 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  53.04 
 
 		 105 aa  110  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  55.93 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  54.7 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  52.99 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  56.9 
 
 		 101 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  51.69 
 
 		 106 aa  104  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  50.42 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  51.28 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  50.43 
 
 		 105 aa  103  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  50.43 
 
 		 105 aa  103  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  50.43 
 
 		 105 aa  103  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  47.86 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  52.14 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  49.15 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  49.14 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  49.57 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  53.45 
 
 		 113 aa  100  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0573  50S ribosomal protein L24  65.28 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  50 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  54.31 
 
 		 100 aa  97.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  49.57 
 
 		 101 aa  96.7  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  46.96 
 
 		 105 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  50.43 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1097  Ribosomal protein L24-like protein  63.89 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  46.22 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  46.61 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  47.93 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2676  50S ribosomal protein L24  45.08 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  45.22 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  45.22 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  45.22 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  45.22 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  45.22 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  45.22 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  45.22 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  45.22 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  45.22 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0598  ribosomal protein L24  62.67 
 
 		 116 aa  84.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  44.83 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  45.22 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  48.67 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  45.22 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3656  50S ribosomal protein L24  48.65 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000160911  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  44.07 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  44.07 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  48 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  52.13 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29630  LSU ribosomal protein L24P  56.67 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.750571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  43.8 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0699  50S ribosomal protein L24  44.53 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  51.14 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2964  50S ribosomal protein L24  44.26 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00916066  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  43.22 
 
 		 112 aa  80.1  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  44.07 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  45.05 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  51.14 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  47.87 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  43.22 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  56.41 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  42.24 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  43.1 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  45.69 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  54.44 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  46.55 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  47.78 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  52.63 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  49.43 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1718  50S ribosomal protein L24  45.38 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  53.41 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  47.78 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  43.36 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  44.92 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  51.9 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  50.56 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  41.38 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  50.56 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  54.79 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  41.04 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  41.38 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  46.24 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  41.53 
 
 		 106 aa  74.3  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0365  50S ribosomal protein L24  56.94 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.889516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  51.9 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  51.9 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  39.5 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  43.88 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0495  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0465  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451517  hitchhiker  0.00000267089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0498  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000033533  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4738  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0127139  normal  0.762072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>