More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1856 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 115 aa  223  8e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  68 
 
 		 105 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  58.82 
 
 		 103 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  63 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 103 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 103 aa  117  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  57.43 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  57.43 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  56.48 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  56.44 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 102 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 113 aa  106  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  60 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1274  ribosomal protein L24  50 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  50.93 
 
 		 111 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  52.48 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 116 aa  97.8  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  51.49 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  46.73 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  47.71 
 
 		 112 aa  95.9  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  55.79 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 104 aa  94  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 105 aa  94  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 107 aa  93.6  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 		 116 aa  94  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 102 aa  93.6  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  47 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  48 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  46 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  46.79 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  48 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  47 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  47 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 101 aa  90.5  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  49 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5776  ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 118 aa  90.1  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0501804  normal  0.536525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  49 
 
 		 102 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0670  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077767  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1563  ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00170276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  40 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1357  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00374615  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  42.72 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 108 aa  87.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  45.87 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3984  ribosomal protein L24  47.27 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  44.23 
 
 		 115 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>