More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3132 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3132  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 115 aa  221  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  82.61 
 
 		 113 aa  184  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  73.91 
 
 		 113 aa  166  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2964  50S ribosomal protein L24  69.75 
 
 		 119 aa  160  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00916066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2676  50S ribosomal protein L24  66.1 
 
 		 120 aa  155  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29630  LSU ribosomal protein L24P  71.43 
 
 		 116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.750571 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0598  ribosomal protein L24  65.18 
 
 		 116 aa  138  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  60.87 
 
 		 113 aa  134  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0699  50S ribosomal protein L24  59.68 
 
 		 123 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  55.12 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  57.52 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0942  50S ribosomal protein L24  60.5 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20760  LSU ribosomal protein L24P  57.26 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  56.64 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  53.98 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  55.75 
 
 		 106 aa  110  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1718  50S ribosomal protein L24  57.89 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  56.52 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  53.1 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  54.87 
 
 		 104 aa  107  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  49.56 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  52.21 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  51.33 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  51.33 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  51.33 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  51.33 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  53.51 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  49.56 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  53.51 
 
 		 105 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  49.56 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  50.44 
 
 		 101 aa  96.7  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  49.56 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  52.29 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  52.29 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  52.29 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  52.29 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  52.29 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  52.29 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  52.29 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  52.29 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  52.29 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  53.21 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  52.29 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  51.75 
 
 		 112 aa  93.6  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  51.69 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  52.73 
 
 		 106 aa  90.1  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  52.29 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  49.11 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  50.46 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  46.49 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  48.62 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  48.21 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  48.21 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  48.21 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  44.64 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  48.21 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  56.04 
 
 		 104 aa  84.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  49.55 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  49.09 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  49.56 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  48.18 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  46.02 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0778  ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000331203  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  46.02 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  52.75 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  46.85 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  44.64 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  48.21 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  46.79 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  46.79 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  45.95 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  46.9 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  48.62 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2313  50S ribosomal protein L24  50.54 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.103377  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  42.48 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  42.48 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  48.91 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  46.43 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0334  ribosomal protein L24  48.39 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000366107  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  47.75 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  47.75 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  50.89 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3327  50S ribosomal protein L24  48.7 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000922916  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  48.35 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0573  50S ribosomal protein L24  58.33 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1097  Ribosomal protein L24-like protein  56.94 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  45.87 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  46.79 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  44.04 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  42.98 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0848  50S ribosomal protein L24  47.31 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0444  50S ribosomal protein L24  50.56 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0162317  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  42.98 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>