More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0386 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 104 aa  202  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  75 
 
 		 104 aa  152  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  66.67 
 
 		 104 aa  124  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 112 aa  121  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 106 aa  113  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  59.05 
 
 		 105 aa  110  8.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 102 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  52.53 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  52.53 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  52.53 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 106 aa  100  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 111 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5776  ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0501804  normal  0.536525 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  53.54 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 109 aa  93.6  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  52.53 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  46.53 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  46.53 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 105 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  44.34 
 
 		 110 aa  90.1  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 106 aa  90.1  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  46 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  44 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  43.52 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0071  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0224  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000086996  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  41.67 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 106 aa  87.4  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  51.11 
 
 		 89 aa  87  7e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  47 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  44.23 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  45.71 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0670  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  44.9 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  41.24 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  46.53 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 106 aa  84.7  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0306  ribosomal protein L24  51.02 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0004461  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  44 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  45.95 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  42.72 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3903  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000356583  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0594  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000014526  normal  0.407014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0294  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000911949  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  42.59 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  46 
 
 		 112 aa  84  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  44 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4533  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114986  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1726  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267784  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0372  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl134  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  43 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  42.57 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  42.57 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3990  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0024494  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2964  50S ribosomal protein L24  51.06 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00916066  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  44 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3811  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0404  ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002398  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4632  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000390519  normal  0.45352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0242  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  47.47 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3698  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000743122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03111  hypothetical protein  49.5 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000161136  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0404  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839278  hitchhiker  0.0000141467 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0416  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000325696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>