More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1158 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 104 aa  200  5e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  75 
 
 		 104 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  66.67 
 
 		 104 aa  126  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  63.64 
 
 		 112 aa  120  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  55.24 
 
 		 106 aa  120  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  61.39 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  59.79 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  59.79 
 
 		 105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  59.79 
 
 		 105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  56.7 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  56.7 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  56.7 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  56.7 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  56.7 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  56.7 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  56.7 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  56.7 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  56.7 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  56.7 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  56.7 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  56.7 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 111 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  57.84 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 110 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  59 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  54.55 
 
 		 113 aa  104  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  47.62 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  54.08 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  52.78 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 107 aa  98.2  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 107 aa  98.2  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  52 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  47 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  52 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  48 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  51 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  47 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1847  ribosomal protein L24  54.08 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.095489999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5776  ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0501804  normal  0.536525 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  48 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 115 aa  94.7  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  55.34 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 104 aa  94.4  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5068  50S ribosomal protein L24  53.61 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000162639  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  53.93 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1718  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0848  50S ribosomal protein L24  51.02 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08960  50S ribosomal protein L24  51.02 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786471  normal  0.0497722 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  49.48 
 
 		 101 aa  93.6  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0224  50S ribosomal protein L24  53 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000086996  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06360  50S ribosomal protein L24  50.52 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127864  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0637  ribosomal protein L24  51.55 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000374833  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4537  50S ribosomal protein L24  51.55 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407127  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3898  50S ribosomal protein L24  51.55 
 
 		 104 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00126984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04510  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 105 aa  91.7  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0040022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  46 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2313  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 105 aa  90.9  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000126749  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0465  50S ribosomal protein L24  50.52 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451517  hitchhiker  0.00000267089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0498  50S ribosomal protein L24  50.52 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000033533  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4738  50S ribosomal protein L24  50.52 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0127139  normal  0.762072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  49.48 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0495  50S ribosomal protein L24  50.52 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 105 aa  90.5  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  49 
 
 		 104 aa  90.5  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 106 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 106 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  45.28 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>