More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0613 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  100 
 
 		 112 aa  216  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  59.62 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  63.64 
 
 		 104 aa  120  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 104 aa  121  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5776  ribosomal protein L24  53.1 
 
 		 118 aa  117  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0501804  normal  0.536525 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 		 111 aa  114  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 103 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  53.77 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  56.07 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  57.43 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  44.35 
 
 		 118 aa  103  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  53.61 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  48.6 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  46 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  53.06 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0437  50S ribosomal protein L24  53 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000277232  hitchhiker  0.0000906767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0486  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000769902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0500  50S ribosomal protein L24  53 
 
 		 105 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000146538  decreased coverage  0.00101346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  51.55 
 
 		 106 aa  95.9  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  42.34 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  46.23 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  45.36 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0495  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000419023  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 104 aa  94.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0331  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000249202  hitchhiker  0.00112167 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 104 aa  94.4  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 104 aa  94.4  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  41.9 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  46.46 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  51.02 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  44 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  44 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1847  ribosomal protein L24  48.15 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.095489999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  39.05 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  51.35 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4232  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000941051  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 105 aa  91.3  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  43.27 
 
 		 106 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 101 aa  90.5  8e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0224  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 104 aa  90.1  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000086996  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  43.27 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2314  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00356207  normal  0.384073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 		 104 aa  88.6  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0392  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0384  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000110242  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  48.98 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  43 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3938  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  47 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1033  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000385068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  50 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 105 aa  88.2  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0612  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00279937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>