More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2676 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2676  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 120 aa  233  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2964  50S ribosomal protein L24  90.68 
 
 		 119 aa  209  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00916066  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  66.95 
 
 		 113 aa  156  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  63.56 
 
 		 113 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  62.71 
 
 		 113 aa  139  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3132  50S ribosomal protein L24  66.1 
 
 		 115 aa  137  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  60.63 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20760  LSU ribosomal protein L24P  63.25 
 
 		 119 aa  133  9e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0699  50S ribosomal protein L24  59.35 
 
 		 123 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0598  ribosomal protein L24  55.65 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29630  LSU ribosomal protein L24P  58.42 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.750571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  52.14 
 
 		 108 aa  114  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  52.14 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0942  50S ribosomal protein L24  56.91 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  51.67 
 
 		 106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  52.14 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 108 aa  107  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  51.67 
 
 		 106 aa  106  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  49.57 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  50.43 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  52.5 
 
 		 111 aa  103  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  49.57 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1718  50S ribosomal protein L24  50.83 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  48.72 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  48.72 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 104 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  48.72 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  48.72 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  49.15 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  48.31 
 
 		 105 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  49.57 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  47.5 
 
 		 112 aa  91.3  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  46.49 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  46.49 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  46.49 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  46.49 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  46.49 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  46.49 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  46.49 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  46.49 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  46.49 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  46.49 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  45.45 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  45.61 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  45.83 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  45.3 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  47.01 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  47.46 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  45.08 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  48.45 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 		 105 aa  84.3  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  46.22 
 
 		 106 aa  84.3  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  47.41 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  43.22 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  47.83 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  43.59 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  47.83 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  46.94 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  43.86 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  43.86 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  42.98 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  47.87 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  43.36 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  42.98 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  42.24 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  44.68 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  42.24 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  42.74 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  42.74 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  43.1 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  52.22 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  40 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  43.33 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  42.24 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  43.1 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  47.42 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  41.88 
 
 		 101 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  44.21 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  44.21 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0330  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.5069e-23  unclonable  0.0000000479114 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  48.39 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  43.59 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  48.39 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0573  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  41.53 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0224  50S ribosomal protein L24  46.61 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000086996  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  42.11 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0505  50S ribosomal protein L24  39.83 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0612161  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0444  50S ribosomal protein L24  40 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0162317  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0778  ribosomal protein L24  43.93 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000331203  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  41.67 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  45.83 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  38.98 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  43.1 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  46.24 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  43.33 
 
 		 104 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>