More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3656 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 104 aa  200  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  93.27 
 
 		 104 aa  190  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  92.31 
 
 		 104 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  90.38 
 
 		 104 aa  186  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  87.5 
 
 		 104 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  89.42 
 
 		 104 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  86.54 
 
 		 104 aa  177  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  74.29 
 
 		 105 aa  154  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  72.38 
 
 		 105 aa  150  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  71.15 
 
 		 104 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  74.26 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  74.26 
 
 		 102 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  77.45 
 
 		 103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  68.27 
 
 		 104 aa  145  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  68.27 
 
 		 104 aa  145  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  70.48 
 
 		 105 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  72.28 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  75.49 
 
 		 103 aa  142  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  73.53 
 
 		 104 aa  143  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  68.27 
 
 		 104 aa  142  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  73.53 
 
 		 104 aa  143  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  74.51 
 
 		 103 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  72.55 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  75.49 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  69.52 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  75.24 
 
 		 105 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  61.9 
 
 		 105 aa  124  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0602  50S ribosomal protein L24  59.6 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  57.58 
 
 		 101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  59.6 
 
 		 101 aa  117  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0265  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 		 101 aa  115  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0644649  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  56.6 
 
 		 106 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  58.1 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2523  50S ribosomal protein L24  54.55 
 
 		 101 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  54.29 
 
 		 107 aa  107  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0372  50S ribosomal protein L24  54.55 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1726  50S ribosomal protein L24  54.55 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267784  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  61.54 
 
 		 106 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 106 aa  106  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  62.5 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  55.45 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 104 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  46.23 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  46.23 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0237  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 110 aa  100  6e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  47.62 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  51 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 		 108 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  44.34 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  49 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  49 
 
 		 100 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0290  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000794802  hitchhiker  0.00000184934 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  47.66 
 
 		 106 aa  93.6  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0670  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077767  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  48 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  43.52 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  44.23 
 
 		 109 aa  92.8  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0486  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000769902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  44.23 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  47.12 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>