More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1260 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 105 aa  206  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  73.33 
 
 		 105 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  76.92 
 
 		 105 aa  153  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  59.41 
 
 		 102 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  63 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  58.42 
 
 		 102 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  58.82 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  58.82 
 
 		 103 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  59 
 
 		 103 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  60.95 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  57.43 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  58.1 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  59.22 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 105 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  56.57 
 
 		 105 aa  106  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  56.57 
 
 		 105 aa  106  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  58.1 
 
 		 105 aa  105  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  55.24 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  55.56 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  58.65 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 105 aa  103  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 104 aa  103  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  54.29 
 
 		 105 aa  103  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  53.54 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  55.56 
 
 		 101 aa  101  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  51.52 
 
 		 101 aa  99.4  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  56.73 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  49.06 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  47.62 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  53 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  48.48 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0237  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 110 aa  94.7  3e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  49.49 
 
 		 104 aa  94.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  53.47 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  58.25 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0602  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 101 aa  92.8  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1274  ribosomal protein L24  48.67 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  44 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 104 aa  90.5  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0265  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 101 aa  90.1  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0644649  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 108 aa  90.1  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 104 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3656  50S ribosomal protein L24  51.85 
 
 		 105 aa  88.6  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000160911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  45.71 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 101 aa  88.6  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  46 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2523  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 101 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  51.09 
 
 		 105 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>