More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2153 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 104 aa  205  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  90.38 
 
 		 104 aa  189  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  90.38 
 
 		 104 aa  188  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  90.38 
 
 		 104 aa  188  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  80.95 
 
 		 105 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  75.24 
 
 		 105 aa  156  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  73.33 
 
 		 105 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  72.38 
 
 		 105 aa  149  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  79.05 
 
 		 105 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  66.35 
 
 		 104 aa  143  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  68.27 
 
 		 104 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  69.23 
 
 		 104 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  67.31 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  66.35 
 
 		 104 aa  140  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  64.42 
 
 		 104 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  67.65 
 
 		 104 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  61.9 
 
 		 105 aa  137  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  62.5 
 
 		 104 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  65.35 
 
 		 102 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 		 103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 		 104 aa  132  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 		 104 aa  132  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  65.69 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 102 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  67.65 
 
 		 103 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  64.71 
 
 		 103 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 102 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 101 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  62.75 
 
 		 101 aa  124  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0602  50S ribosomal protein L24  62.75 
 
 		 101 aa  120  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2523  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0372  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1726  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267784  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  60.38 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  60.58 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  61.9 
 
 		 104 aa  117  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0265  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 101 aa  116  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0644649  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  58.1 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 105 aa  104  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  58 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  53 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0670  50S ribosomal protein L24  53.77 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3903  50S ribosomal protein L24  58.1 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000356583  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0594  50S ribosomal protein L24  58.1 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000014526  normal  0.407014 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  57.69 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0294  50S ribosomal protein L24  58.1 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000911949  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  48.57 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3740  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000337214  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  53 
 
 		 105 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  53 
 
 		 105 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03160  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000206027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0404  ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002398  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0416  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000325696  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3792  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256632  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3625  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000301612  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3604  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000161475  normal  0.0245278 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03111  hypothetical protein  56.19 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000161136  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3503  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000502759  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3733  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.012207  normal  0.015742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3796  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3694  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000331178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0404  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839278  hitchhiker  0.0000141467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4632  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000390519  normal  0.45352 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3625  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00533524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3698  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000743122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  50.48 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0334  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000849803  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4533  50S ribosomal protein L24  55.24 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114986  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3990  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0024494  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 106 aa  98.6  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 109 aa  98.2  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  49 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3811  50S ribosomal protein L24  55.24 
 
 		 104 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0242  50S ribosomal protein L24  54.29 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0210  50S ribosomal protein L24  54.29 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>