More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1127 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
107 aa  213  5.9999999999999996e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  79.25 
 
 
106 aa  175  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  74.76 
 
 
105 aa  161  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  74.76 
 
 
105 aa  161  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  67.96 
 
 
106 aa  149  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  71.57 
 
 
105 aa  146  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  61.17 
 
 
104 aa  140  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  63.37 
 
 
106 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  64.36 
 
 
107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  61.39 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  60 
 
 
105 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  63.81 
 
 
105 aa  130  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  63.46 
 
 
110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  60.58 
 
 
104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  53.85 
 
 
109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  59.62 
 
 
104 aa  128  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  61 
 
 
106 aa  128  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 
105 aa  126  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  56.86 
 
 
109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  57.43 
 
 
106 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 
103 aa  123  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
106 aa  123  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 
105 aa  123  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 
103 aa  123  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  53.92 
 
 
103 aa  123  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  59.05 
 
 
104 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  59.05 
 
 
104 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 
103 aa  120  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 
103 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 
104 aa  120  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 
110 aa  120  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 
106 aa  120  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 
103 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  54.63 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 
103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  52.78 
 
 
110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  50.98 
 
 
103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  59.05 
 
 
105 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  52.38 
 
 
105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
103 aa  117  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
103 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
103 aa  117  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
103 aa  117  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
103 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
103 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
103 aa  117  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
103 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
103 aa  117  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
103 aa  117  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 
103 aa  116  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 
104 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 
104 aa  116  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 
104 aa  116  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  56.73 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
106 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  58.82 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
103 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  58.1 
 
 
104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  51.89 
 
 
112 aa  114  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 
103 aa  114  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 
107 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 
102 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  54.72 
 
 
107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  57.14 
 
 
105 aa  113  6.9999999999999995e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 
106 aa  113  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
108 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  55 
 
 
106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  57.61 
 
 
105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  52 
 
 
110 aa  111  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 
102 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  52.43 
 
 
105 aa  111  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  52.58 
 
 
107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  51.38 
 
 
109 aa  110  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 
106 aa  110  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  48.6 
 
 
116 aa  110  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  54.46 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0970  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000143141  hitchhiker  0.000000947265 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  54 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  54 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 
102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 
108 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0878  50S ribosomal protein L24  57.01 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0510214  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  52.38 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 
104 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  54.29 
 
 
104 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  52.73 
 
 
114 aa  107  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2313  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
105 aa  106  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.103377  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2158  ribosomal protein L24  53.85 
 
 
104 aa  106  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0775088  normal  0.23262 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1407  ribosomal protein L24  50 
 
 
101 aa  106  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  58.65 
 
 
106 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>