More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1784 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  100 
 
 		 104 aa  198  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  69.23 
 
 		 105 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  73 
 
 		 102 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  70.19 
 
 		 105 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  70.3 
 
 		 104 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  67.31 
 
 		 105 aa  140  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  69 
 
 		 103 aa  140  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  64 
 
 		 103 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  65.38 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  63 
 
 		 103 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  72 
 
 		 102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  65 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  69 
 
 		 102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  64.42 
 
 		 105 aa  136  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  63 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  62 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  62 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  62 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  62 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  62 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  62 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  62 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  62 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  62 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 104 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  63.73 
 
 		 106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  62.38 
 
 		 104 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  63.81 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  75.73 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  63.46 
 
 		 104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  62 
 
 		 103 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  66.35 
 
 		 104 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  64.42 
 
 		 105 aa  127  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  61.54 
 
 		 104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  60.58 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  60.58 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  68.27 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  62.5 
 
 		 104 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  57.69 
 
 		 104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 101 aa  122  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  59 
 
 		 103 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  62.63 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  62.63 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  63.64 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  59.05 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  58.65 
 
 		 112 aa  120  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  58.1 
 
 		 107 aa  120  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  59.62 
 
 		 104 aa  120  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  58.65 
 
 		 104 aa  120  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  60.58 
 
 		 104 aa  120  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  62.5 
 
 		 104 aa  120  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  62.5 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  58.1 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0602  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 		 101 aa  118  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  60.58 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  57.69 
 
 		 104 aa  117  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 103 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 		 101 aa  116  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  57.69 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0265  50S ribosomal protein L24  58.82 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0644649  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  58.59 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1726  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 		 101 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267784  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0372  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 		 101 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  53.85 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  57.69 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  57.69 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2523  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 101 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0224  50S ribosomal protein L24  57.69 
 
 		 104 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000086996  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_002978  WD0670  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077767  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0848  50S ribosomal protein L24  57.73 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08960  50S ribosomal protein L24  57.73 
 
 		 104 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786471  normal  0.0497722 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 105 aa  110  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06360  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  110  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04510  50S ribosomal protein L24  54.72 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0040022  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0071  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0465  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451517  hitchhiker  0.00000267089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4738  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0127139  normal  0.762072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0242  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0637  ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000374833  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4537  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407127  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0498  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000033533  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0210  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216375  unclonable  0.0000000000129617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0205  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0210  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0495  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  57.43 
 
 		 107 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0169  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000484148  hitchhiker  0.000323291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3898  50S ribosomal protein L24  55.67 
 
 		 104 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00126984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5068  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000162639  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0505  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 110 aa  106  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0612161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  48.11 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0181  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000129578  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0195  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000100309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0334  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000849803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0211  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000151512  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>