More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2190 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
104 aa  206  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
104 aa  206  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  92.31 
 
 
104 aa  194  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  90.38 
 
 
104 aa  188  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  84.76 
 
 
105 aa  175  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  79.05 
 
 
105 aa  166  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  78.1 
 
 
105 aa  164  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  74.29 
 
 
105 aa  157  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  82.86 
 
 
105 aa  153  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  71.15 
 
 
104 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  66.35 
 
 
104 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  70.3 
 
 
102 aa  146  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  74.51 
 
 
103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  68.27 
 
 
104 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  67.31 
 
 
104 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  67.31 
 
 
104 aa  144  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  67.33 
 
 
102 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  65.38 
 
 
104 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  67.33 
 
 
102 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  67.65 
 
 
104 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  64.42 
 
 
104 aa  140  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  69.61 
 
 
104 aa  140  6e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  69.61 
 
 
104 aa  140  6e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  67.65 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  61.9 
 
 
105 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 
103 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  65.69 
 
 
103 aa  137  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  60.95 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  62.75 
 
 
101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  58.82 
 
 
101 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  59.05 
 
 
107 aa  121  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  60 
 
 
104 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0602  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 
101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2523  50S ribosomal protein L24  58.82 
 
 
101 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  57.55 
 
 
106 aa  117  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1726  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 
101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267784  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0372  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 
101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0265  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 
101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0644649  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  59.62 
 
 
106 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  60.58 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
108 aa  111  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  53.77 
 
 
106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  54.46 
 
 
107 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 
105 aa  107  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 
104 aa  107  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 
104 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 
106 aa  106  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  48.57 
 
 
112 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  46.15 
 
 
109 aa  104  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
106 aa  103  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  52 
 
 
105 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  54 
 
 
104 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  52 
 
 
105 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 
103 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 
103 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 
103 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 
103 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 
103 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 
103 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 
103 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 
103 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 
103 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 
106 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 
103 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_002978  WD0670  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 
105 aa  101  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077767  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 
103 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
105 aa  100  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 
105 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  47.12 
 
 
105 aa  100  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 
105 aa  100  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 
105 aa  100  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 
108 aa  100  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  47.17 
 
 
106 aa  100  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  50.49 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  47 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0594  50S ribosomal protein L24  54.29 
 
 
104 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000014526  normal  0.407014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3903  50S ribosomal protein L24  54.29 
 
 
104 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000356583  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0294  50S ribosomal protein L24  54.29 
 
 
104 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000911949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3990  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0024494  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  48.04 
 
 
106 aa  98.2  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3811  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03160  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000206027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0404  ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002398  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3625  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00533524  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3792  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256632  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3796  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307428  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3503  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000502759  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0404  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839278  hitchhiker  0.0000141467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3698  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000743122  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3625  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000301612  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3733  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.012207  normal  0.015742 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4632  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000390519  normal  0.45352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0416  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000325696  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3604  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000161475  normal  0.0245278 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03111  hypothetical protein  53.33 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000161136  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3694  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000331178  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  47.62 
 
 
104 aa  97.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>