More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2144 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  100 
 
 
112 aa  227  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
106 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  54.29 
 
 
105 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 
105 aa  116  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  50.48 
 
 
105 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  54.29 
 
 
105 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  55.45 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  55 
 
 
105 aa  114  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  55 
 
 
105 aa  114  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  57.55 
 
 
105 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 
105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 
103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  49.11 
 
 
119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  55.45 
 
 
102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  58.1 
 
 
105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 
103 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 
103 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  54 
 
 
105 aa  108  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 
106 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 
103 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 
106 aa  108  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 
108 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  53 
 
 
106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  58.65 
 
 
104 aa  107  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  107  6e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  51.96 
 
 
104 aa  107  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  107  6e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  52.48 
 
 
107 aa  106  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 
106 aa  106  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
104 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 
108 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
104 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 
102 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  56.73 
 
 
106 aa  104  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
104 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 
104 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
104 aa  104  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  49.53 
 
 
106 aa  104  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
106 aa  104  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 
105 aa  103  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 
105 aa  103  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  44.14 
 
 
112 aa  103  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  52.48 
 
 
105 aa  102  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 
117 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 
104 aa  102  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 
117 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 
102 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  50.98 
 
 
106 aa  102  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
104 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  53.57 
 
 
113 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  52.68 
 
 
113 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 
101 aa  100  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
110 aa  100  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  47.62 
 
 
104 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
105 aa  100  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 
102 aa  100  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  50.48 
 
 
105 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
104 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
108 aa  100  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 
106 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  51.09 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  49.06 
 
 
104 aa  98.2  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  43.14 
 
 
103 aa  97.8  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  49.48 
 
 
102 aa  97.8  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 
115 aa  97.8  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 
104 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  50.98 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  42.34 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 
104 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  49 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  46.53 
 
 
106 aa  95.9  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  46.53 
 
 
122 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  43.27 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  49.51 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  50 
 
 
118 aa  94.7  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
105 aa  94  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 
101 aa  94  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  47.52 
 
 
101 aa  93.6  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2221  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 
113 aa  94  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  46.39 
 
 
110 aa  93.6  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>