More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1927 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 106 aa  209  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  63.81 
 
 		 111 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  59.62 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  63.37 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 106 aa  129  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  61 
 
 		 103 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  61 
 
 		 103 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  61 
 
 		 103 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  61 
 
 		 103 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  61 
 
 		 103 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  61 
 
 		 103 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  61 
 
 		 103 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  61 
 
 		 103 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  62 
 
 		 103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  61 
 
 		 103 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  63 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  62 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  60.58 
 
 		 115 aa  124  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  62 
 
 		 103 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5776  ribosomal protein L24  59.22 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0501804  normal  0.536525 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  54.29 
 
 		 106 aa  123  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  61.39 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 		 106 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 105 aa  117  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 105 aa  117  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  57 
 
 		 109 aa  117  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  56 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 105 aa  114  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  56 
 
 		 105 aa  114  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  56 
 
 		 105 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 106 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 105 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  56.73 
 
 		 104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  58.16 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  53.27 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  50.46 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1626  ribosomal protein L24  56.6 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 105 aa  110  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 106 aa  108  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  53 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  55.24 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  53 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 106 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  48.48 
 
 		 102 aa  102  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  53 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  49 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  56 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  44.34 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  46.67 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  51.89 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  49 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  50.47 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  45.63 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  40.74 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  51.65 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  47.96 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 104 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  47.62 
 
 		 104 aa  99.4  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  51.82 
 
 		 113 aa  97.4  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2896  ribosomal protein L24  48.45 
 
 		 113 aa  97.8  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  49.48 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 110 aa  97.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  46 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  45.61 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 105 aa  96.7  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 106 aa  95.9  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>