More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3437 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 104 aa  203  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  87.5 
 
 		 104 aa  185  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  88.46 
 
 		 104 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  87.5 
 
 		 104 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  89.42 
 
 		 104 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  87.5 
 
 		 104 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  84.62 
 
 		 104 aa  177  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  76.19 
 
 		 105 aa  156  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  73.33 
 
 		 105 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  74.26 
 
 		 102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  74.51 
 
 		 104 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  71.15 
 
 		 104 aa  150  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  71.15 
 
 		 104 aa  150  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  71.15 
 
 		 104 aa  150  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  73.27 
 
 		 102 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  73.33 
 
 		 105 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  72.55 
 
 		 104 aa  147  7e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  72.55 
 
 		 104 aa  147  7e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  70.3 
 
 		 102 aa  146  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  75.49 
 
 		 103 aa  144  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  70.48 
 
 		 105 aa  144  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  72.55 
 
 		 103 aa  144  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  71.57 
 
 		 103 aa  142  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  69.23 
 
 		 104 aa  142  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  70.59 
 
 		 103 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  77.14 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  63.81 
 
 		 105 aa  131  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  62.86 
 
 		 104 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 106 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  63.46 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  57.58 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 		 106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0602  50S ribosomal protein L24  56.57 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  55.24 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  54.55 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  60.58 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0265  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0644649  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  56.44 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2523  50S ribosomal protein L24  53.54 
 
 		 101 aa  104  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  48.57 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 103 aa  104  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1726  50S ribosomal protein L24  52.53 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0372  50S ribosomal protein L24  52.53 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  52 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  47.66 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 105 aa  100  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 105 aa  100  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  44.34 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  48 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0237  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0670  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077767  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 105 aa  93.6  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  43.27 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0334  50S ribosomal protein L24  54.29 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000849803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 108 aa  90.5  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  44.23 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3990  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0024494  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3811  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 104 aa  90.5  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 102 aa  90.1  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>