More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0670 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD0670  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
105 aa  199  9.999999999999999e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077767  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  54.72 
 
 
105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  56.6 
 
 
105 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  56.6 
 
 
105 aa  111  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
106 aa  103  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 
105 aa  102  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  58.1 
 
 
106 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  53.77 
 
 
104 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 
103 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  56.44 
 
 
105 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  56.44 
 
 
105 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 
106 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 
104 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 
104 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 
103 aa  101  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  50.47 
 
 
106 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 
103 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  57.43 
 
 
105 aa  100  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  100  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0224  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 
104 aa  100  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000086996  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 
102 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 
103 aa  100  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 
103 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 
102 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 
102 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 
103 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 
104 aa  98.6  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  54.72 
 
 
105 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0071  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 
103 aa  98.2  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  57.14 
 
 
104 aa  97.8  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 
103 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  53.77 
 
 
104 aa  94.7  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 
104 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 
104 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 
104 aa  93.6  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 
104 aa  93.6  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  47.22 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
101 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  48.11 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0372  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1726  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  51.89 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0420  50S ribosomal protein L24  50.46 
 
 
109 aa  92  3e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.177045  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0290  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
105 aa  91.3  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000794802  hitchhiker  0.00000184934 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0265  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0644649  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04510  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 
105 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0040022  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0602  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
101 aa  90.9  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2313  50S ribosomal protein L24  49.06 
 
 
105 aa  91.3  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.103377  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  48.6 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2523  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 
101 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03160  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000206027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0404  ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002398  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3625  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00533524  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3503  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000502759  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3796  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307428  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3604  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000161475  normal  0.0245278 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3792  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256632  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3698  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000743122  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4632  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000390519  normal  0.45352 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0404  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839278  hitchhiker  0.0000141467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3811  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3733  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.012207  normal  0.015742 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  56 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3625  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000301612  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03111  hypothetical protein  50.94 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000161136  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0416  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000325696  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3694  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000331178  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0594  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000014526  normal  0.407014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3903  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000356583  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0294  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000911949  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 
104 aa  89  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3990  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0024494  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 
102 aa  89.4  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0505  50S ribosomal protein L24  46.73 
 
 
110 aa  88.2  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0612161  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0330  50S ribosomal protein L24  48.15 
 
 
106 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.5069e-23  unclonable  0.0000000479114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0334  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000849803  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  50.98 
 
 
115 aa  88.2  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  50 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4533  50S ribosomal protein L24  49.06 
 
 
104 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114986  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0242  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 
104 aa  88.2  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0970  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 
105 aa  87.8  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000143141  hitchhiker  0.000000947265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>