More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4787 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
105 aa  205  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  84.76 
 
 
105 aa  178  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  84.76 
 
 
105 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  78.1 
 
 
105 aa  169  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  79.41 
 
 
104 aa  166  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  78.1 
 
 
104 aa  164  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  78.1 
 
 
104 aa  164  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  78.1 
 
 
104 aa  164  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  81.37 
 
 
103 aa  163  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  86.67 
 
 
105 aa  160  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  78.43 
 
 
103 aa  159  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  77.14 
 
 
104 aa  159  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  78.43 
 
 
103 aa  158  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  77.45 
 
 
103 aa  158  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  74.51 
 
 
104 aa  155  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  74.51 
 
 
104 aa  155  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  73.33 
 
 
104 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  74.29 
 
 
104 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  78.43 
 
 
102 aa  153  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  73.33 
 
 
104 aa  152  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  77.45 
 
 
102 aa  152  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  77.45 
 
 
102 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  72.38 
 
 
104 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  73.33 
 
 
104 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  73.33 
 
 
104 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  74.29 
 
 
104 aa  150  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  63.81 
 
 
105 aa  142  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  63.81 
 
 
107 aa  130  6.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  70.19 
 
 
104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  69.23 
 
 
106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  61.9 
 
 
106 aa  127  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  60.38 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  57.55 
 
 
106 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 
106 aa  120  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  60.4 
 
 
103 aa  120  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  59.41 
 
 
103 aa  120  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  59.41 
 
 
103 aa  120  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  59.41 
 
 
103 aa  120  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  59.41 
 
 
103 aa  120  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  59.41 
 
 
103 aa  120  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  59.41 
 
 
103 aa  120  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  59.41 
 
 
103 aa  120  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  59.41 
 
 
103 aa  120  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  59.41 
 
 
103 aa  120  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  59.41 
 
 
103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  61.17 
 
 
101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  59.43 
 
 
105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  54.29 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  60.4 
 
 
105 aa  116  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  60.95 
 
 
105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  59.41 
 
 
101 aa  114  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  56 
 
 
106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  60.38 
 
 
104 aa  113  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  55.45 
 
 
103 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0602  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 
101 aa  110  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  56.44 
 
 
107 aa  110  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 
103 aa  110  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 
101 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
108 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0670  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077767  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  56 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  56 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  50.96 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2523  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 
101 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  51.4 
 
 
106 aa  107  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  51.96 
 
 
101 aa  107  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  54 
 
 
105 aa  107  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1726  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 
101 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267784  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0372  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 
101 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 
104 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 
108 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  55.24 
 
 
105 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 
106 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0265  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 
101 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0644649  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 
108 aa  104  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  49 
 
 
109 aa  103  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  52.38 
 
 
105 aa  104  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  52 
 
 
108 aa  103  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  48.54 
 
 
106 aa  103  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  46.15 
 
 
109 aa  103  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 
105 aa  103  7e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 
105 aa  103  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  49 
 
 
110 aa  102  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 
106 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 
104 aa  102  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0237  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 
110 aa  102  2e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
108 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  53.06 
 
 
106 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  49 
 
 
108 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 
107 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 
107 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  48.15 
 
 
109 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  49.5 
 
 
100 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 
105 aa  100  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
106 aa  100  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  52.94 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 
102 aa  99  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0970  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 
105 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000143141  hitchhiker  0.000000947265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  47.62 
 
 
104 aa  99  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 
104 aa  98.6  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>