More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1196 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 104 aa  205  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  68.27 
 
 		 104 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  67.31 
 
 		 108 aa  150  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  66.35 
 
 		 106 aa  147  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  65.38 
 
 		 104 aa  147  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  69.23 
 
 		 106 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  64.76 
 
 		 108 aa  143  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  64.76 
 
 		 105 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  64.76 
 
 		 105 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  64.76 
 
 		 105 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  64.76 
 
 		 108 aa  140  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  60.58 
 
 		 104 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  59.05 
 
 		 105 aa  136  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  60.95 
 
 		 105 aa  134  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  59.05 
 
 		 105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  58.1 
 
 		 105 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  55.24 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  51.35 
 
 		 114 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  58.65 
 
 		 101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  58.65 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  53.15 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0942  50S ribosomal protein L24  53.78 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  51.35 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 105 aa  103  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 101 aa  103  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 		 103 aa  103  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  49.09 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  49.57 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2964  50S ribosomal protein L24  47.86 
 
 		 119 aa  100  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00916066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2676  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 120 aa  100  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  47.62 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 		 106 aa  93.6  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  48 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29630  LSU ribosomal protein L24P  60.53 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.750571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  49 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  49 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0409  ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 102 aa  91.3  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  44.04 
 
 		 118 aa  90.9  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  49 
 
 		 104 aa  91.3  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  48 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 105 aa  90.5  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  46.67 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1097  Ribosomal protein L24-like protein  55.42 
 
 		 101 aa  89.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20760  LSU ribosomal protein L24P  50.85 
 
 		 119 aa  89.4  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  40.62 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  43 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  43.81 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  42.86 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  48.54 
 
 		 112 aa  87.4  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  42 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  43.56 
 
 		 102 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0602  50S ribosomal protein L24  46 
 
 		 101 aa  86.7  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0598  ribosomal protein L24  51.14 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  46 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  41.18 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  41.18 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  42.57 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>