More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4310 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  100 
 
 
100 aa  193  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  78.22 
 
 
101 aa  147  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  71.29 
 
 
101 aa  142  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  68.27 
 
 
104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  60.58 
 
 
106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  62.5 
 
 
104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  62.86 
 
 
105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 
108 aa  116  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  57.69 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 
108 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  59.62 
 
 
106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  58.65 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  59.05 
 
 
105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 
105 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 
104 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 
105 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 
105 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  52 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  52.88 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
104 aa  104  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  51.96 
 
 
103 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  56.86 
 
 
101 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  52 
 
 
104 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 
105 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 
103 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 
103 aa  101  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 
105 aa  101  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 
105 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 
105 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  53 
 
 
103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  53 
 
 
103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  53 
 
 
103 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  53 
 
 
103 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  53 
 
 
103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 
105 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  53 
 
 
103 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  53 
 
 
103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  53 
 
 
103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  53 
 
 
103 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  53 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  54 
 
 
103 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  97.8  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  54.31 
 
 
123 aa  97.4  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0505  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
110 aa  96.7  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0612161  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0432  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0323669  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  49 
 
 
104 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  94.7  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  94.7  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  54 
 
 
104 aa  94.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0444  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 
105 aa  94.7  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0162317  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 
105 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  49 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  48 
 
 
104 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
106 aa  94  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
106 aa  94  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  51.52 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  43.56 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  48 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  43.56 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 
104 aa  92.8  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  46.53 
 
 
105 aa  92  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  46.53 
 
 
106 aa  92  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 
103 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 
107 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  49 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  47 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  49.02 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 
119 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 
109 aa  91.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  46 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  46 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  46.53 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4265  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655615  unclonable  0.00000000000267825 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  50.45 
 
 
114 aa  90.9  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0238  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 
117 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0241  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 
117 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 
103 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  48 
 
 
104 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  90.1  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  47.42 
 
 
106 aa  90.1  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  47.52 
 
 
112 aa  89.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  47.17 
 
 
118 aa  88.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  49.55 
 
 
113 aa  88.6  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  46 
 
 
108 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  45.54 
 
 
105 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08960  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 
104 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786471  normal  0.0497722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>