More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0118 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 103 aa  200  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  97.09 
 
 		 103 aa  194  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  88.35 
 
 		 103 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  86.41 
 
 		 103 aa  177  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  86.41 
 
 		 103 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  86.41 
 
 		 103 aa  177  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  86.41 
 
 		 103 aa  177  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  86.41 
 
 		 103 aa  177  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  86.41 
 
 		 103 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  86.41 
 
 		 103 aa  177  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  86.41 
 
 		 103 aa  177  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  86.41 
 
 		 103 aa  177  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  86.41 
 
 		 103 aa  177  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  72.73 
 
 		 105 aa  149  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  72.73 
 
 		 105 aa  149  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  71.72 
 
 		 105 aa  147  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  71.84 
 
 		 106 aa  146  9e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  68.63 
 
 		 101 aa  135  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  67.65 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  65.35 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  63 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  59.22 
 
 		 106 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 115 aa  123  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  58.72 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  59.62 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  59.62 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  59.22 
 
 		 107 aa  120  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 		 101 aa  120  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 106 aa  120  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  56.44 
 
 		 105 aa  120  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 108 aa  120  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  60.19 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  60.78 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  59.8 
 
 		 106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  58.49 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  57 
 
 		 105 aa  117  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  56 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  60.78 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  54.81 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  55 
 
 		 112 aa  114  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  57.43 
 
 		 104 aa  113  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  53.47 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  56.12 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  53 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  53 
 
 		 103 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  53 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 105 aa  110  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 111 aa  110  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 109 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 103 aa  110  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 103 aa  110  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09890  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00648346  hitchhiker  0.00000717269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 105 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 108 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 113 aa  106  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  50.91 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  53.54 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  59.41 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  50.91 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  54.9 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  59 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  53 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  47.62 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  50.91 
 
 		 110 aa  104  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 108 aa  103  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>