More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6038 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 108 aa  214  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  86.11 
 
 		 108 aa  194  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  68.57 
 
 		 104 aa  150  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 		 104 aa  146  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  64.76 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  65.71 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  64.76 
 
 		 104 aa  140  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  63.21 
 
 		 105 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  63.21 
 
 		 105 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  63.21 
 
 		 105 aa  136  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  60.38 
 
 		 105 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  62.26 
 
 		 105 aa  134  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  60.95 
 
 		 104 aa  134  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  58.49 
 
 		 106 aa  131  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  60.38 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  57.02 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  59.43 
 
 		 105 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  59.05 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0942  50S ribosomal protein L24  55.74 
 
 		 122 aa  123  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 101 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  53.7 
 
 		 105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 100 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 		 103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2676  50S ribosomal protein L24  52.14 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  52.25 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 		 103 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  54.72 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2964  50S ribosomal protein L24  59.78 
 
 		 119 aa  110  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00916066  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  48.65 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  49.04 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  51.85 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 103 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 105 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 107 aa  107  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 104 aa  106  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 104 aa  106  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 103 aa  105  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 104 aa  105  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  49.52 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  47.62 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  47.27 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3714  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  49.14 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  46.67 
 
 		 106 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  40.74 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  47.62 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  45.71 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 105 aa  98.2  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  41.98 
 
 		 128 aa  97.4  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2570  50S ribosomal protein L24  47.62 
 
 		 115 aa  97.4  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949988  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  48 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3001  50S ribosomal protein L24  48 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.445857  hitchhiker  0.00605598 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0702  50S ribosomal protein L24  47.62 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000192817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  47.62 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  46.53 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 105 aa  95.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  43.52 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  41.9 
 
 		 107 aa  94.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 104 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1303  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  49 
 
 		 108 aa  93.6  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  45.63 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  47.25 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  42.57 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>