More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0699 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0699  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 123 aa  235  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  65.04 
 
 		 113 aa  130  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2964  50S ribosomal protein L24  60.16 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00916066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2676  50S ribosomal protein L24  59.35 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  55.73 
 
 		 128 aa  120  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20760  LSU ribosomal protein L24P  57.26 
 
 		 119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  59.02 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  54.03 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3132  50S ribosomal protein L24  60.16 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  51.24 
 
 		 111 aa  103  8e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1718  50S ribosomal protein L24  50.41 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  48.76 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  46.22 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0942  50S ribosomal protein L24  49.25 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  42.52 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  47.15 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  43.75 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29630  LSU ribosomal protein L24P  51.4 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.750571 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  47.5 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  45.83 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  45.83 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0598  ribosomal protein L24  47.9 
 
 		 116 aa  88.2  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  49.57 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  45.83 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  44.54 
 
 		 101 aa  86.7  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  42.74 
 
 		 106 aa  85.9  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  47.01 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  55.42 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  40.16 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  45.53 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  45.53 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  45.83 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  49.45 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  43.44 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06360  50S ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127864  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  56.94 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  44.63 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  41.53 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  44.63 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  45.38 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  41.38 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  40.52 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  43.09 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  44.35 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  41.38 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  44.72 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  50 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  44.72 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04510  50S ribosomal protein L24  47.54 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0040022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  41.67 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  44.53 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0848  50S ribosomal protein L24  51.58 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3898  50S ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00126984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08960  50S ribosomal protein L24  51.58 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786471  normal  0.0497722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0465  50S ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451517  hitchhiker  0.00000267089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0498  50S ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000033533  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4738  50S ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0127139  normal  0.762072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0495  50S ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  54.17 
 
 		 104 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  45.3 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  42.28 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  42.28 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  41.53 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  42.74 
 
 		 105 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  42.28 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  52.69 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  44.92 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  41.13 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  42.28 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  45.53 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  42.24 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  46.88 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  43.09 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0637  ribosomal protein L24  49.47 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000374833  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4537  50S ribosomal protein L24  49.47 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407127  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5068  50S ribosomal protein L24  49.47 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000162639  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  43.9 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  40.98 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  41.32 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  43.33 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  40.65 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0330  50S ribosomal protein L24  44.92 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.5069e-23  unclonable  0.0000000479114 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0348  50S ribosomal protein L24  43.2 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000772359  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  46.32 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1843  50S ribosomal protein L24  43.2 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  41.94 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  45.83 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  41.88 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>