More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0317 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  100 
 
 
114 aa  224  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  59.65 
 
 
108 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  60.36 
 
 
108 aa  130  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  57.02 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  60.36 
 
 
106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  59.82 
 
 
106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  59.46 
 
 
105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0942  50S ribosomal protein L24  58.2 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0905403  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  59.46 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  58.56 
 
 
105 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  58.56 
 
 
105 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  58.56 
 
 
105 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  53.15 
 
 
104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  59.46 
 
 
104 aa  123  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  55.86 
 
 
104 aa  120  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  56.76 
 
 
105 aa  117  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  55.86 
 
 
105 aa  117  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  52.68 
 
 
113 aa  113  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  51.35 
 
 
104 aa  113  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  50.88 
 
 
106 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17050  50S ribosomal protein L24  50.45 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000932171  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  55.93 
 
 
123 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  55.86 
 
 
101 aa  108  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  52.73 
 
 
107 aa  107  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2676  50S ribosomal protein L24  49.57 
 
 
120 aa  105  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2964  50S ribosomal protein L24  50.85 
 
 
119 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00916066  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0638  ribosomal protein L24  51.35 
 
 
113 aa  103  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  50.88 
 
 
106 aa  103  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  48.21 
 
 
103 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  45.95 
 
 
103 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  45.61 
 
 
106 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  45.95 
 
 
103 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  46.85 
 
 
107 aa  101  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  52.25 
 
 
107 aa  100  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  47.75 
 
 
105 aa  100  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  47.75 
 
 
105 aa  100  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  47.66 
 
 
104 aa  99.4  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  48.62 
 
 
103 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  47.66 
 
 
110 aa  98.2  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  48.6 
 
 
110 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  48.62 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  47.71 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0573  50S ribosomal protein L24  57.3 
 
 
105 aa  98.2  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1097  Ribosomal protein L24-like protein  58.62 
 
 
101 aa  97.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  48.15 
 
 
103 aa  97.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  45.61 
 
 
106 aa  97.4  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23690  LSU ribosomal protein L24P  41.22 
 
 
128 aa  97.1  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0826239  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  48.25 
 
 
106 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  46.3 
 
 
103 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  48.18 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  48.65 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  47.37 
 
 
106 aa  94.7  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  46.85 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  46.85 
 
 
108 aa  94  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  46.85 
 
 
108 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  43.24 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  45.05 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  46.73 
 
 
110 aa  92.8  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  45.05 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  45.95 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 
110 aa  92  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  44.64 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  46.85 
 
 
109 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  39.29 
 
 
109 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  43.64 
 
 
105 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  44.14 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  50.45 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
103 aa  90.9  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  48.15 
 
 
112 aa  90.5  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  44.74 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
103 aa  90.5  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  48.65 
 
 
101 aa  90.5  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  43.86 
 
 
107 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
103 aa  90.1  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3132  50S ribosomal protein L24  51.75 
 
 
115 aa  89.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0699  50S ribosomal protein L24  43.75 
 
 
123 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  42.34 
 
 
103 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  43.24 
 
 
105 aa  88.6  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  44.74 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  42.2 
 
 
106 aa  87.8  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  47.27 
 
 
104 aa  87.4  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0691  50S ribosomal protein L24  44.04 
 
 
108 aa  87.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  46.36 
 
 
105 aa  87  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  44.14 
 
 
118 aa  87  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  46.85 
 
 
101 aa  87  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  44.14 
 
 
112 aa  86.7  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29630  LSU ribosomal protein L24P  48.35 
 
 
116 aa  86.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.750571 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  45.45 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0263  ribosomal protein L24  47.32 
 
 
111 aa  86.3  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 
103 aa  85.9  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0287179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>